雌激素和血清中的激素及各种生长因子在乳腺癌的发生发展过程中发挥重要作用。研究雌激素和血清对乳腺癌细胞中蛋白质组成和含量的影响对于阐明雌激素和血清对乳腺癌细胞影响的分子机理具有重要意义。它莫西芬(TAM)是临床上广泛用于雌激素反应性乳腺癌治疗的药物,了解TAM对乳腺癌细胞内蛋白质产物水平的影响,有助于理解其诱导乳腺癌细胞生长阻滞的分子机理。我们利用四重iTRAQ标记结合2DLC-MS/MS实验分别对雌二醇(E2)、血清剥夺(SD),和E2、TAM单独及联合作用对MCF-7乳腺癌细胞内蛋白质表达的影响进行了研究。在E2和SD处理实验中,通过Q-TOF串联质谱分析,以不含E2的血清培养组为对照,共找到94种差异表达在0.5倍以上的蛋白质,21种蛋白质在含E2的血清培养组上调,16种蛋白质下调;无血清培养组找到上调蛋白质10个,下调27个;含E2的无血清培养组19个蛋白质上调,22个下调。在E2与TAM处理实验中,通过MALDI-TOF-TOF串联质谱分析,以未加药物处理组为对照,共找到表达变化在0.5倍以上的47种蛋白质,其中16种蛋白质在E2处理组上调,22种蛋白质下调;TAM处理组找到上调蛋白质4个,下调8个;E2+TAM共同处理组6个蛋白质上调,1个下调。比较ESI-Q-TOF以及MALDI-TOF-TOF对E2刺激前后MCF7细胞中的蛋白质进行定性和定量的结果,发现两种仪器在蛋白质定性和定量分析方面有很大的互补性。将两种仪器结合使用,不仅能够显著提高蛋白质定性和定量分析的覆盖率,而且可以提高分析的置信度。