民营企业自产生以来，一直为我国的经济发展贡献着自己的力量。然而其特有的股权结构却为大股东侵害中小股东的利益创造了机会。而注册会计师审计作为一种经济鉴证机制，通过对财务报表进行审计，可以增加被审计单位财务信息的可信赖程度，以缓解因信息不对称而造成的公司投资人、经营者以及其他利益相关者之间的代理冲突。金融危机后，会计师事务所面临着来自客户削减审计收费的压力，人们为此对审计质量表示担忧。2014年，国家发改委发布了关于放开审计收费的通知后，更是引起了业内热议，并再次将人们的注意力转移到审计收费的相关研究中来。文章回顾了国内外有关股权结构和审计收费的研究文献，在探讨股权结构对审计收费影响的相关理论的基础上，分析了我国审计收费的现状，选取了2011年至2013年深沪主板市场中披露审计费用的民营上市公司的数据为研究样本，并将民营企业细分为家族企业和非家族企业，在此基础上构建了多元线性回归模型，分别进行描述性分析、多元线性回归分析。通过理论分析和实证检验，文章得到如下结论：民营上市公司的股权结构能够影响审计收费，上市公司可以通过优化股权结构达到节省审计费用的目的，注册会计师能够通过观察被审计单位的股权结构特征来确定其带来的可能的审计风险，从而更加合理地确定审计收费水平。同时，文章提出了优化民营上市公司股权结构和引导会计师事务所确立合理的审计收费水平的政策建议，以期降低审计风险，提高审计质量。