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传染性支气管炎(Infectious bronchitis, IB)是由传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus, IBV)引起鸡的一种急性、高度接触传染性、病毒性呼吸道和生殖道传染病。传染性支气管炎感染可导致母鸡产蛋性能降低或蛋品质下降,可引起商品肉鸡的增重和饲料报酬降低,增加鸡群的发病死亡率,造成巨大的经济损失。传染性支气管炎的高度传染性及传染性支气管炎病毒(IBV)血清型的复杂性,使免疫预防复杂化和预防成本增加,因此如何控制IB具有重要经济意义。本研究对从四川地区分离到37株IBV毒株S1基因进行序列测定,并进行分子流行病学分析；进一步对应用活苗+灭活苗免疫程序下不同周龄的种鸡抗体水平和不同产蛋期雏鸡的母源抗体水平进行检测,建立生产实际中有效的疫苗筛选和评估办法。(1)分离鉴定了2009-2010年采集37株IBV毒株。流行病学分析表明：禽传染性支气管炎在冬春季节多发(11-4月份),20天龄内多呼吸型,40天龄后以肾型为主。(2)对37株分离株进行S1基因的序列测定。序列比对结果表明S1基因发生碱基突变、插入、缺失情况,表现为S1基因不同的核苷酸和编码的氨基酸数量。37株分离株有三种裂解位点基序。(3)用MEGA4.0分析软件对37株分离株和33株参考株的S1基因进行系统发育分析,聚类形成6个主要的基因型(基因型Ⅰ-Ⅵ),结果显示37株分离株中有14株IBV毒株聚类为CHI,2株工BV毒株聚类为CHII,6株IBV毒株聚类为CHIII,1株IBV毒株聚类为CHIV,14株IBV毒株聚类为CHV。所有分离株间的核苷酸和氨基酸相似性分别为77.6-99.6%和74.4-99.4%。(4)种鸡通过前期(2周内)两次传支弱毒苗的免疫后抗体得到一定的上升(1200-1500),结合后备阶段(5周-15周)两次油苗免疫,抗体滴度可提升到5000以上,产蛋期周期性活苗免疫,38周左右油苗加强免疫可使种鸡抗体水平维持在5000-12000滴度范围内,雏鸡母源抗体水平可维持在2000～5000滴度范围内。(5)传染性支气管炎无特效治疗办法,生产上需通过建立完善的生物防控体系、环境控制和饲养办法,结合适宜的疫苗,有条件的可选用当地分离株制备灭活油苗联合免疫,降低传染性支气管炎发病率