ST段抬高型心肌梗死与稳定性冠心病Circular RNAs差异表达谱及生信分析

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研究背景 冠心病根据临床表现可分为两种类型:稳定性冠心病和急性冠脉综合征。稳定性冠心病包括三种类型:慢性稳定性劳力型心绞痛、缺血性心肌病和急性冠脉综合征之后的稳定阶段。作为急性冠脉综合征的一种类型,ST段抬高型心肌梗死是由冠状动脉完全或近全闭塞,导致心肌细胞急性缺血缺氧所致的临床综合征。环状RNAs是一种由共价键连接闭合成环的非编码RNA,因其稳定性、进化上的保守性和组织-发育阶段特异性,使其成为多种疾病研究热点。本研究旨在探讨ST段抬高型心肌梗死与稳定性冠心病环状RNAs差异表达谱,并通过GO分析与KEGG通路分析探索差异表达环状RNAs参与ST段抬高型心肌梗死的可能机制。研究方法 收集山东大学齐鲁医院2021年5月至2021年10月收治PCI术后24小时内STEMI患者及未行介入治疗稳定性冠心病患者外周血,分离外周血单个核细胞,行全转录组高通量测序。对测序结果进行层次聚类分析,对差异表达环状RNAs亲本基因行包括GO分析和KEGG通路分析在内的生物信息学分析。根据入组患者表达数目和统计学差异程度,筛选出亲本基因与心血管系统相关的环状RNAs,构建circRNAs-miRNAs-genes网络,重新收集两组患者样本行qRT-PCR验证差异。预测验证结果一致环状RNAs可能结合的miRNAs及上游基因,分析miRNAs及上游基因涉及病理生理进程,预测环状RNAs在STEMI疾病进程中发挥的作用。研究结果 高通量测序结果显示,STEMI组相比SCAD组有4650个环状RNAs显着上调,3746个显着下调。差异表达环状RNAs亲本基因的GO分析显示,其主要涉及蛋白甲基化、蛋白泛素化、核孔结构构建等过程。亲本基因的KEGG通路分析显示,其主要涉及细胞内吞、内质网蛋白合成及内毒素诱导炎症反应等过程。我们筛选出6个差异表达的环状RN As(has-circ-0001127,has-circ-0001163,has-circ-0001518,has-circ-0003 75 7,has-circ-0006628,has-circ-0132148)构建 circRNAs-miRNAs-genes 网络,经过 qRT-PCR 验证有 5 个环状RNAs(has-circ-0001127,has-circ-0001163,has-circ-0001518,has-circ-0003757,has-circ-0006628)与测序结果一致。我们筛选出8个可能共同结合多个环状RNAs的miRNAs(hsa-mi R-2355-3p,hsa-miR-4651,hsa-miR-4712-5p,hsa-miR-5006-3p,hsa-miR-501-5p,hsa-miR-608,hsa-miR-6505-3p,hsa-miR-770-5p)。通过对 miRNAs 及上游基因分析,环状 RNAs 可能通过影响心肌细胞线粒体功能进而影响线粒体介导的细胞凋亡进程,介导炎症反应进程等参与STEMI发生发展过程。研究结论 环状RNAs在STEMI和SCAD之间存在差异表达。对差异表达环状RNAs的生信分析显示,环状RNAs可能通过调节影响细胞凋亡、介导炎症反应进程影响STEMI病理生理过程。这为后续STEMI机制研究,提供了思路。
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