【摘 要】
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目的:使用生物信息学方法,寻找与胰腺癌预后相关的基因;然后使用免疫组织化学法,分析RAD18在胰腺癌中的表达及临床意义。方法:胰腺癌相关的微阵列数据集来源于GEO数据库,应用R语言的limma包进行差异性分析来获取共同差异基因;应用cluster Profiler包对差异基因进行GO及KEGG富集分析;为获取关键基因,STRING在线数据库和Cytoscape软件被用于构建蛋白-蛋白相互作用网络;
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目的:使用生物信息学方法,寻找与胰腺癌预后相关的基因;然后使用免疫组织化学法,分析RAD18在胰腺癌中的表达及临床意义。方法:胰腺癌相关的微阵列数据集来源于GEO数据库,应用R语言的limma包进行差异性分析来获取共同差异基因;应用cluster Profiler包对差异基因进行GO及KEGG富集分析;为获取关键基因,STRING在线数据库和Cytoscape软件被用于构建蛋白-蛋白相互作用网络;GEPIA在线数据库验证关键基因在胰腺癌组织中的表达差异,并分析关键基因对胰腺癌患者预后的影响;最后使用免疫组织化学染色法,在组织学层面验证RAD18在胰腺癌组织中的表达情况及其对胰腺癌患者预后的影响。结果:在GSE15471和GSE62452两个数据集中,共获得212个共同差异基因。胰腺癌差异基因主要富集于细胞外基质-受体的相互作用、蛋白质消化与吸收、粘着斑以及PI3K-Akt信号通路。PPI网络筛选了十个关键基因。预后分析结果表明,RAD18表达与患者较短的总生存期和无病生存期有关。免疫组织化学染色结果示,RAD18在胰腺癌组织中阳性表达,其阳性率显著高于邻近非癌组织（p＜0.05）,且其表达水平与患者的TNM分期和淋巴结转移有关。Kaplan-Meier生存分析示:RAD18表达越高,患者的总生存期越低。多变量COX回归分析表明RAD18表达、肿瘤大小以及TNM分期可作为胰腺癌患者总生存期的预测因子。结论:RAD18在胰腺癌中阳性表达,其表达水平与胰腺癌患者预后呈负性相关,未来有望成为胰腺癌诊断及预测预后的潜在生物标志物。
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