随着农村经营体制改革推进，无锡市土地流转工作进入新的阶段，农村集体经济组织运行处在变化完善之中，农业经营效益的提高对制度建设、组织管理等都提出了更高的要求。农村土地制度是农村集体经济组织管理运行的基础，农村集体经济组织运行机制伴随着农村土地制度的变迁不断得到形塑和发展。为实现无锡市土地流转制度完善、农村集体经济组织运行机制优化，最基础最关键的是推导出土地流转制度对农村集体经济组织运行机制的影响规律。本文通过引入人力资本产权，借助企业合约理论等构建了土地制度对农村集体经济组织运行机制影响的逻辑框架。在对无锡市的实际研究中，以时间为导向，先对无锡市土地内部流转制下农村集体经济组织运行机制的分析展开对逻辑框架的验证和运用，揭示了影响的具体规律和特征，再据此对土地外部流转制下农村集体经济组织运行机制展开实证分析，发现和总结当前无锡市农村土地流转制度和农村集体经济组织运行机制建设的不足。文章最后对影响规律进行总结，并提出无锡市土地流转制度完善和农村集体经济组织运行机制优化的建议。本文的价值在于，突破了传统上针对土地流转制度或农村集体经济组织运行开展单一研究的思路。研究发现，土地流转制度中人力资本产权的界定与分配规则成为影响农村集体经济组织初始产权安排的重要因素，人力资本参与下经营者产权的不同配置对农村集体经济组织分配机制和管理制度产生实质性影响，进而构成对农村集体经济组织内部剩余产权分配的影响。