国库集中收付制度是公共财政管理体系的一项重要内容,其目标是建立以国库单一账户体系为基础,资金缴拨以国库集中收付为主要形式的现代财政国库管理制度。我国从2001年开始推行国库集中收付改革,到2005年底,副省级以上城市全面启动。改革实践表明,国库集中收付对加强财政资金使用监督,提高资金拨付效率和使用效率等方面发挥了积极的作用。同时在推行国库集中支付改革的过程中,也存在一系列问题,有国库集中收付制度本身的问题,但更多的是运行机制方面的问题,这些问题影响了国库集中收付积极作用的发挥。因此,如何进一步完善国库集中收付制度的运行机制成为理论界和实际部门函待解决的重要问题。国库集中收付制度的改革,是一项十分复杂的系统工程,涉及财政部门、人民银行、预算单位、商业银行等多个部门,牵一发而动全局；国库集中收付制度改革又是预算管理体系改革的组成部分,这项改革离不开其他相关制度的协调协调配合；同时,国库集中收付制度作为现代国库管理制度,还离不开法律制度、现代信息技术的支持。从公共管理的角度来看,财政是政府的会计机构,国库是财政的出纳机关,国库集中收付制度的改革应涉及到部门预算、政府采购、预算会计、制度设计等多个方面,政府资金管理应该是多个相关部门的配合协调才能顺畅进行,一项制度的执行也必然需要相应的环境和条件支持。目前,发达国家的国库基本制度已经日趋完善,我国在这方面起步较晚,因此,有必要对国际上典型国家的做法进行研究分析,学习和借鉴他们的宝贵经验。通过比较国外一些国家的国库集中收付制度的做法,借鉴吸收国外的经验,来研究完善国库集中收付制度运行机制的对策。完善我国国库集中收付制度运行机制首先要转变政府理财理念,树立公共财政的理念和科学理财观,为改革奠定基础；其次要健全国库集中收付制度的配套制度,建立适应改革进行的环境条件,相关部门协调配合,以确保改革顺利进行；再次,在实施国库集中收付制度的成功案例说明,建立会计集中核算制度与国库集中收付制度相融合的创新模式具有必要性和可行性,可以解决我国现阶段国库集中收付制度改革中存在的一些问题；最后要建立国库集中收付制度的监督约束体系,明确监督约束体系实施主体的监督责任,对国库集中收付制度进行全过程的监督约束,以确保制度运行的各个环节有序运行,使国库集中收付的作用得到充分的发挥。