FGF1 rs34002和PRKCE rs629772与延边地区肝细胞癌易感性的相关性研究

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研究背景:肝细胞癌(HepatoXellular XarXinoma,HCC),简称肝癌,是全世界最常见的肝脏恶性肿瘤之一。据2020年全球癌症统计数据显示,肝癌是全球癌症相关死亡的第三大原因。肝癌的发病率和死亡率在全球癌症中分别位于第6位和第3位,在中国,2020年因肝癌死亡人数为39.1万,仅次于肺癌。以往的研究表明,肝癌的发生发展与多种因素相关,包括感染肝炎病毒(乙型肝炎病毒HBV、丙型肝炎病毒HCV),烟酒过量,食用含有黄曲霉毒素的食物,患有肝硬化疾病和糖尿病。除以上常见因素之外,遗传因素也是导致肝癌发病的非常重要的原因。而肝癌相关的遗传变异中,数量最多的为单核苷酸多态性(Single NuXleotide Polymorphisms,SNP)变异。单核苷酸多态性是人体重要的遗传变异形式之一,具有高度遗传稳定性,能够改变基因的结构或表达量进而改变基因对机体的调控。多项研究证实,SNP是导致机体对药物反应或疾病易感性差异的重要原因之一。但目前有关肝癌易感性与SNP相关性的研究较少,因此,针对肝癌易感性与SNP之间的相关性研究对于肝癌的早期诊断与治疗具有重要意义。研究目的:探讨FGF1 rs34002和PRKCE rs629772单核苷酸多态性与延边地区肝细胞癌易感性的相关性,为早期筛选肝细胞癌高危人群及发掘新的肝细胞癌易感性标志物提供可靠的理论依据。材料与方法:1.研究对象:本研究共选择2011年至2017年在延边医院和延边肿瘤医院被确诊为肝癌的470名患者为实验组研究对象,随机选择了同期在这两个医院体检的470名健康人作为对照组。2.Regulome-SNP的选择:首先,在前期利用Regulome-DB数据库筛选出与HCC易感性相关的Regulome-SNP位点。再通过NCBI-SNP数据库和Hapmap-SNP数据库筛选出其中中国汉族人群次要等位基因频率(Minor allele frequenXy,MAF)>10%和连锁不平衡(LD)r~2<0.8的SNP,并通过NCBI-SNP数据库确认其基因。接着通过病例对照研究筛选与HCC易感性相关的Regulome-SNP(P<0.05)。3.DNA提取与基因分型:使用半自动核酸提取仪QuiXk Gene-810及QuiXk Gene DNA whole blood kit S试剂盒(日本KURABO公司)提取全血中的DNA后进行样本质量测定。设计PCR引物,对包含SNP位点的DNA模板片段进行扩增,通过特异性引物进行单碱基延伸反应,再进行SAP反应及树脂纯化。最后通过质谱分析仪对SNP位点进行基因分型。4.统计分析:利用SPSS 26.0进行统计学分析。通过X~2检验和t检验比较实验组与对照组之间在性别、年龄、民族、吸烟、饮酒以及疾病史等因素及基因型分布频率的差异。利用二元LogistiX回归模型,分析不同SNP基因型与HCC易感性的风险比值比(OR),并计算其95%可信区间。结果:1.SNP基因型检测及峰值图:通过质谱分析仪检测SNP位点的基因型,并获取基因型峰值图。2.Hardy-Weinberg遗传平衡检验:经拟合优度X~2检验分析,实验组与对照组的基因型分布频率符合Hardy-Weinberg遗传平衡检验的要求(P>0.05)。3.研究对象一般资料:统计结果显示,实验组与对照组的饮酒状况、肝炎史和肝硬化史情况具有显著性差异(P<0.05),但性别、年龄、民族和吸烟状况等无明显无差异(P>0.05)。4.SNP基因型分布频率与HCC易感性的相关性:X~2检验结果显示,FGF1 rs34002的三种基因型在实验组与对照组的分布情况的差异无统计学意义(P>0.05),PRKCE rs629772的三种基因型在实验组与对照组的分布情况的差异具有统计学意义(P<0.05)。二元LogistiX回归分析显示,携带FGF1 rs34002 TT、TG基因型的人患HCC的风险比为1.612和1.522(调整OR=1.612,95%CI=1.061-2.447,P=0.025;调整OR=1.522,95%CI=1.025-2.262,P=0.038),以及携带PRKCE rs629772 TT基因型的人患HCC的风险比为1.415(调整OR=1.415,95%CI=1.089-1.839,P=0.009)。5.危险基因型数量与HCC易感性的分析:危险基因型数量与HCC易感性呈正相关,携带2种危险基因型的人患HCC的风险高于未携带者(调整OR=2.261,95%CI=1.333-3.833,P=0.002)。结论:FGF1 rs34002(T>G)和PRKCE rs629772(T>C)单核苷酸多态性与中国延边地区肝细胞癌易感性显著相关,携带FGF1 rs34002TT、TG和PRKCE rs629772TT基因型的人患肝细胞癌的风险更高。
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