在分子遗传学领域,RNA作为核糖体的结构成分,参与了遗传信息的表达。RNA编辑是一种后转录过程,发生在DNA转录成RNA的过程中,解读生物的遗传密码需要从微观的角度对RNA编辑进行探讨与分析。RNA数据具有数据量庞大、质量参差不齐、测量难度大等特点,这给检测与识别RNA编辑事件带来了挑战。现有相关的检测与识别软件都具有运行速度慢,检测结果可信度不高,无法表示及表达RNA编辑事件等缺点。此外,研究生物的遗传或疾病信息需要利用多个RNA样本数据进行对比,分析样本间特性,并探究编辑差异对生物机理的影响。因此,一套完整的RNA编辑检测识别、可视化与多样本分析的解决方案具有重要的研究意义。在前人研究的基础上,本文将信息处理技术应用于RNA编辑事件的识别与分析上,完善了检测及提取流程,实现了多种提取参数的调节。首先,针对RNA编辑事件的可视化问题,本文开发了一款基于Java和MySQL技术的软件——核糖核酸编辑检测器(RNA Editing Detector,RED),仅需简单地配置,便可用于RNA编辑事件的检测、识别、过滤、可视化及数据分析,全平台可运行。RED从海量高通量测序数据中检测并提取真正的RNA编辑事件,借助了数据库引擎的优势,运行速度极快。完善的RNA提取与过滤流程使得检测结果的可信度得到了一定的提高。不仅如此,RED还可以同时显示上百万个碱基位点,展示基于基因组的RNA编辑的总体蓝图,多样化输出可视化结果。其次,为了体现RNA编辑事件的研究价值,本文在课题组研究人员的共同努力下,提出了一套多样本特性分析的流程与工具。本文以十对肝癌组织及其对应的正常比对组织为基础,从微观角度研究乙肝病毒的发病机理。通过全新的视角对肝癌组织与正常组织的RNA编辑分布情况、特定功能区域的位点以及RNA编辑的特异性表达等进行深入分析,通过实验,说明了肝癌致使人类身体内的A-to-I编辑发生了混乱,而ADAR1和ADAR2酶通过不同的表达水平调控着A-to-I编辑的不平衡,患者肿瘤中ADAR1的过表达和ADAR2的表达下调增加了肝硬化的风险,从而为进一步研究肝癌基因的病变提供了可靠的实验基础。