非人灵长类肠道MDR大肠杆菌毒力基因与耐药基因相关性及基因盒阵列分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yiteng89
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大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli),又称为大肠埃希氏菌,是一种条件致病菌,在一定条件下可引起人和多种动物发生胃肠道感染,威胁着人和动物的健康。抗菌药物在临床中的大量使用导致大肠杆菌耐药性逐渐增高,从而使大肠杆菌成为多种耐药基因的储存库和耐药基因交换的重要场所。大肠杆菌病是造成非人灵长类动物濒危的原因之一,对我国珍稀保护动物非人灵长类的保护产生了严重威胁。目前对于人和畜禽耐药性的研究较多,但对野生动物耐药性研究较少。本研究对我国12家动物园的非人灵长类肠道大肠杆菌进行毒力基因及耐药基因检测,分析非人灵长类肠道多重耐药大肠杆菌的毒力基因、耐药基因携带情况以及两者之间的相关性。旨在阐释毒力基因与抗生素耐药基因之间的潜在关联,为多重耐药大肠杆菌的致病风险评估、传播防控提供理论依据,对我国野生动物大肠杆菌病的防治具有重要意义。本试验对实验室保存的全国12家动物园分离的444株圈养非人灵长类肠道多重耐药大肠杆菌毒力基因进行检测,并对分离株进行了系统进化分群。使用PCR方法对5大类20种毒力基因进行检测,结果显示共检出16种不同的毒力基因,携带率最高为fim C 79.50%(353/444),其次为papA 75.90%(337/444)、sitA 45.95%(204/444)、iss 43.69%%(194/444)、irp2 42.57%(189/444)与omp T 31.31%、fyu A 31.31%(139/444),其余毒力基因检出率均低于30%,未检出est A、est B、elt以及hly F。12家动物园非人灵长类肠道多重耐药大肠杆菌的20种毒力基因检出率差异极显著(P<0.01)。使用PCR方法对三种系统进化分群相关基因进行扩增,结果显示A群系分离株占比最高(34.91%,155/444),其次为B1群(23.42%,104/444)、B2群(22.97%,102/444),D群系占比最低为(18.69%,83/444)。同时,将本试验检测的毒力基因与实验室前期检测的耐药基因进行了相关性分析。结果显示,共计58对毒力基因之间存在显著相关性,53对毒力基因呈正相关,5对毒力基因呈负相关,其中tsh与hly A呈最强的正相关(OR,124.00;95%CI,10.04-1531.81)。共计52对耐药基因之间存在显著相关性,49对耐药基因呈正相关,3对耐药基因呈负相关,其中aacc4与tet C呈最强的正相关(OR,24.00;95%CI,5.08-113.61)。共计54对毒力基因与耐药基因之间存在显著相关性,其中31对呈正相关,23对呈负相关,tet G与tsh呈最强的正相关(OR,27.06;95%CI,2.22-329.77)。最后,本研究还对162株1类整合酶阳性菌与12株2类整合酶阳性菌进行了整合子-基因盒可变区检测,共检出12种不同的1类整合子-基因盒阵列与2种不同的2类整合子-基因盒阵列。其中以aad A2-dfr A12-orf F基因盒阵列数量最多。首次在圈养非人灵长类源大肠杆菌携带的1类整合子中检测到介导β-内酰胺类抗生素耐药的基因盒阵列blaCARB-2。本研究表明,圈养非人灵长类肠道多重耐药大肠杆菌携带多种毒力基因与耐药基因,是毒力基因与耐药基因的贮存宿主。毒力基因以fim C与pap A为主,系统进化分群以A群最为流行。分离株携带的毒力基因与耐药基因之间存在显著相关性。圈养非人灵长类动物整合酶阳性大肠杆菌携带多种基因盒阵列,是多种耐药基因水平传播的途径之一。
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