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应用RAPD和ISSR两种分子标记技术,本文对分布于内蒙古西鄂尔多斯地区珍稀小灌木长叶红砂种群的遗传多样性进行了分析。分析结果表明,用18个RAPD引物和14个ISSR引物分别对5个种群共85个长叶红砂DNA样品进行扩增,分别得到118个(其中多态性位点105个)和114个(其中多态性位点99个)清晰的扩增位点,多态性位点百分数(PPB)分别为88.98%和86.84%。两种分子标记均表明长叶红砂具有较高的遗传多样性水平。Nei’s基因多样性指数(HE)表明,大部分遗传变异存在于种群内。RAPD分析发现85.86%的遗传变异发生在种群内;ISSR分析也表明89.36%的遗传变异存在于种群内。种群之间变异水平低的主要原因是种群间存在较强的基因流(Nm分别为4.3159和4.7299)。长叶红砂较高的遗传多样性水平与物种特性和对高胁迫环境的长期适应有关,濒危植物并不一定表现为遗传变异水平的降低。RAPD所揭示的长叶红砂遗传多样性无论是物种水平(HO=0.4966,HE=0.3303)还是种群水平(HO=0.4228,HE=0.2853)均高于ISSR分析所得的结果(物种水平:HO=0.4688,HE=0.3084;种群水平:HO=0.4111,HE=0.2753)。因此,在研究长叶红砂物种的遗传多样性并试图确定种群间或个体间的遗传关系时,RAPD分子标记技术比ISSR分子标记技术更为合适。对长叶红砂RAPD的遗传距离和ISSR的遗传距离之间的相关性系数P=0.814>0.05。研究结果表明:长叶红砂5个种群的遗传多样性水平与生态因子(主要为海拔高度和土壤因素)的相关性不显著(P>0.05)。而且,长叶红砂遗传距离和地理距离之间也不存在显著的相关性(P>0.05)。本文还对RAPD和ISSR的检测结果进行了比较,发现两者之间存在的差异明显。RAPD在多态位点比率、Shannon信息指数和Nei’s基因多样性指数指标方面,揭示出比ISSR更高的遗传多样性和遗传分化。