环棱螺属部分种类DNA条形码研究及其系统发育分析

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环棱螺属(腹足纲:田螺科)广泛分布我国各种淡水水体,其中分布最广泛的有方形环棱螺(Bellamya quadrata, Benson),梨形环棱螺(Bellamya purificata, Heude)和铜锈环棱螺(Bellamya aeruginosa, Reeve)。本文以环棱螺属为研究对象,探讨了线粒体COI基因与16SrRNA基因作为其DNA条形码的可行性?并分析了该属若干物种的系统发育。本论文的研究内容分为2个部分:第一部分:以环棱螺属为研究对象,探讨线粒体COI基因和16SrRNA基因作为DNA条形码进行物种鉴定的可行性。主要依据为遗传距离的差异及分子系统发育的结构两个方面。其中遗传分析均在MEGA4.0软件中进行,系统发育树的构建在PAUP,Phyml和MrBayes软件中完成。结果显示,种间遗传距离大于种内遗传距离,并且同一物种的不同个体均形成单系。尽管遗传距离未达到Hebert(2000)建议的“标准序列阈值”认为种间平均遗传距离应该为种内平均遗传距离的10倍,但考虑地理分布和类群的特殊性,结合遗传距离与分子发育系统树的结果,支持COI可作为环棱螺属DNA条形码的分子标记,16SrRNA可以作为环棱螺属DNA条形码的备选分子标记基因。第二部分:联合线粒体COI基因序列及16SrRNA基因序列构建了环棱螺属(若干种几种或种群)系统发育树,探讨了环棱螺属内部物种的系统发育关系。系统发育树拓扑结构显示(多少种)环棱螺属分为三个类群,铜锈环棱螺与梨形环棱螺互为姊妹群,并且同一物种的不同个体均形成单系。另外,本文不支持双旋环棱螺作为一个独立有效种存在,建议将其并入铜锈环棱螺。
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