肾透明细胞癌肿瘤组织中异常表达的长链非编码RNA筛选及临床意义探讨

来源 :大连医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiangshuhua
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景:在泌尿系统恶性肿瘤中,肾细胞癌(Renal cell carcinoma,RCC)造成的死亡率位居第二位,每年新增病例超过40万例。在肾细胞癌病理中,占比例最高的是病理亚型是肾透明细胞癌(clear cell Renal Cell Carcinoma,ccRCC),约占80%以上,是临床碰到的最常见的病理类型和治疗对象。近年来,多种诊断以及治疗手段的进步已经大大提高了包括肾透明细胞癌在内的肾细胞癌患者的诊断率和治愈率,并且显著提高了患者的生存期和生活质量。然而,还有很大一部分的患者在确诊肾透明细胞癌的时候已经发现肿瘤细胞转移到远处,失去手术治疗的时机,对患者远期预后产生不良影响。因此,进一步探索肾癌特别是肾透明细胞癌发病发展以及复发转移的潜在机制,寻找有效可靠的肾癌进展和治疗靶点的生物标志物具有重要意义。科学研究发现,DNA序列可转录为具有编码蛋白质功能的信使RNA(messenger RNA,mRNA)在人基因组中大约只有2%,但是转录为不具有编码蛋白质功能的RNA约有90%。我们把这90%的RNA称为非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)。lncRNAs(long no coding RNAs)是一类序列保守性低且长度超过200个碱基的一类ncRNA分子。随着基因组学发展,科研人员发现在各种恶性肿瘤组织和正常组织中lncRNAs表达具有明显差异,包括肾透明细胞癌,并且在恶性肿瘤的形成、浸润、转移等过程中均发挥重要功能,已成为新的潜在的肿瘤标志物。但是目前对肾透明细胞癌与lncRNA的关系临床研究较少,因此,本课题旨在探讨lncRNAs和肾透明细胞癌之间的关系,发现新的肾透明细胞癌的生物标志物,为诊治肾透明细胞癌探索新的方法和思路。研究目的:利用自主研发的lncRNAs芯片和RT-PCR技术从肾透明细胞癌患者肿瘤组织中筛选出表达异常的lncRNAs,利用数据库分析肾透明细胞癌患者的差异表达lncRNAs与患者生存期的关系,并对这些lncRNAs的功能和表达进行初步探索。研究方法:1.经同济大学附属上海市东方医院生物伦理委员会同意,我们前期收集在同济大学附属上海市东方医院泌尿外科进行的肾恶性肿瘤根治手术治疗患者的肿瘤组织和癌旁组织(即肿瘤外缘正常组织),组织切片病理分析所取肿瘤的病理类型,选取肾透明细胞癌作为我们的研究对象。2.我们前期研究通过阅读大量文献选出具有肿瘤促进或者肿瘤抑制功能密切相关的长链非编码RNA(lncRNAs)特别是在其他肿瘤中有相关研究而在肾透明细胞癌中研究甚少的lncRNAs,查询这些lncRNAs的基因序列并设计合成引物,采用384微孔板,设计出一个用于筛选异常表达长链非编码RNA的高通量芯片板用于肿瘤和对应癌旁中差异表达的lncRNAs筛选。3.抽提肾透明细胞癌肿瘤组织及对应的癌旁组织RNA,检测RNA浓度和抽提质量,利用高通量lncRNA芯片板检测并对比肿瘤组织和癌旁组织中lncRNAs的表达差异水平,进行统计学分析,筛选肾透明细胞癌组织中差异表达lncRNAs。4.利用数据库分析肾透明细胞癌患者的肿瘤组织和癌旁组织中lncRNAs的表达差异水平同患者生存期的关系。5.利用慢病毒感染技术在肾透明细胞癌细胞系A498和SW839细胞中构建外源性高表达lncRNA BCYRN1和lncRNA CAHM的稳定细胞系,为后续采用体外细胞和体内小鼠荷瘤实验以及多种分子生物学手段研究lncRNA BCYRN1和lncRNA CAHM的功能做前期准备。研究结果:1.我们经过近两年的积累,收集了 35例肾恶性肿瘤组织和癌旁组织,并对这些组织进行固定包埋,切片染色后进行病理,发现34例为肾细胞癌,1例为肾盂尿路上皮癌。在肾细胞癌中31例为肾透明细胞癌,占肾细胞癌患者的85%,并根据染色结果进行病理分期。2.Real time PCR 结果显示 lncRNA BCYRN1 和 lncRNA CAHM 在肾透明细胞癌组织中表达明显高于癌旁组织。3.利用数据库分析显示肿瘤组织中lncRNA BCYRN1和lncRNA CAHM高表达的肾透明细胞癌患者生存预期差。4.在肾透明细胞癌细胞A498和SW839细胞系分别外源性高表达lncRNA BCYRN1和lncRNA CAHM,成功构建了稳定转染的细胞株用于后续实验研究。结论:1.我们收集的肾恶性肿瘤患者术后组织,肾透明细胞癌类型占肾细胞癌的80%以上,与其他研究的结果一致。2.lncRNAs芯片筛选到数个肾透明细胞癌患者肿瘤组织中表达异常的lncRNA。3.lncRNA BCYRN1和lncRNA CAHM在肾透明细胞癌患者肿瘤组织中表达明显高于癌旁组织,预后分析显示lncRNA BCYRN1和lncRNA CAHM高表达的肾透明细胞癌患者生存预期差。4.在肾细胞癌细胞中分别成功构建了 lncRNA BCYRN1和lncRNA CAHM外源性过表的稳定细胞株,过表达效率高,为后续研究提供了细胞学基础。
其他文献
目的:探讨替加环素(Tigecycline)对重症感染患者凝血功能影响的临床特点,观察并分析这些重症感染患者在应用替加环素时出现凝血功能障碍的共同特点及影响因素,为临床应用替加环素提供更多应用经验,尤其是重症监护室的患者有重要的意义。重症感染本身对这些患者已经是非常严重的打击,若能及时发现这些患者使用替加环素的特点及影响因素,积累更多临床经验,有望能避免严重的并发症出现,在达到抗感染的基础上,能更
学位
目的:1.探究急性心肌梗死(Acute Myocardial Infarction,AMI)患者发病6小时内外周血lncRNA ANRIL的异常表达情况,评估ANRIL对AMI的诊断价值;2.分析ANRIL与AMI相关诊断指标、炎症因子方面的相关性;3.探究体外心肌细胞缺氧/复氧处理后的ANRIL表达及细胞凋亡、增殖情况;4.分析ANRIL对缺氧/复氧处理后心肌细胞凋亡、增殖的影响。方法:一、临床
学位
目的本研究旨在观察降钙素原(procalcitonin,PCT)、D-二聚体(D-dimer)、抗凝血酶Ⅲ(antithrombinⅢ,AT-Ⅲ)、血小板分布宽度(platelet distribution width,PDW)与脓毒症患者病情的关系,探讨其在评估预后中的价值。方法回顾性分析2019年1月至2020年12月在青岛市市立医院住院期间诊断为脓毒症的212例患者,收集患者基本信息、入院2
学位
研究背景及目的:脓毒症相关性脑病(Sepsis associated encephalopathy,SAE)是一种弥散性大脑功能障碍,主要是由于脓毒症引起,且没有相关证据可以证明中枢神经系统感染,SAE是脓毒症患者最严重并发症之一,具有极高的发病率和病死率,目前临床上对于SAE的诊断和治疗还缺乏特异性方法。西维来司他钠(Sivelestat sodium hydrate,Siv)是一种中性粒细胞弹
学位
目的:1.分析血清SNHG15水平对急性脑梗死(ACI)的诊断价值。2.分析ACI病人血清SNHG15表达水平与炎症因子、神经受损程度、预后及TOAST分型的关联。3.研究SNHG15表达对细胞增殖凋亡、血管形成、细胞周期的调控作用。方法:此次研究方法分为三部分一、基因测序:通过高通量测序检测3个ACI患者与3个正常人血清中长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)的
学位
目的探究老年卒中患者肠道屏障功能的变化;果胶对改善老年卒中患者肠道屏障损伤的作用,观察果胶干预后对老年卒中患者营养状况的影响,为老年脑卒中患者的整体治疗提供帮助。方法纳入2020年11月至2021年10月泰州市人民医院重症医学科行肠内营养的老年卒中患者共68例。其中32例患者使用常规肠内营养液,为对照组;另外36例患者在常规肠内营养液基础上添加果胶,为果胶组。在肠内营养的第1天、第7天采用微量法进
学位
目的:回顾性分析2012年-2020年大连医科大学附属第一医院真菌血症患者的基础资料、菌株分布、药敏结果、死亡率;通过体外实验研究中药和厚朴酚对白色念珠菌生长的影响,为临床的抗真菌药物治疗提供新思路。方法:对大连医科大学附属第一医院2012年-2020年间所有血培养为真菌的患者基础资料进行回顾性分析,应用WHONET 5.6软件对患者真菌血症病原体药敏实验结果、菌株分布进行统计学分析。通过微量稀释
学位
背景心脏手术相关性急性肾损伤(CSA-AKI)是由心脏手术所导致的不良后果,现根据改善全球肾脏病预后组织(KDIGO)指南,使用肌酐与尿量值来作为它的诊断及分期标准。但血清肌酐和尿量无法在最初24-48小时内监测到CSA-AKI的发生,存在一定的滞后性,因此,早期预测CSA-AKI就成为了目前的研究热点。近年来,有相关研究结果已经证实生物体内存在可用于早期诊断CSA-AKI的生物标志物,包括胱抑素
学位
目的:提高脓毒症休克患者组织灌注对于改善预后具有重要价值,本研究以动静脉二氧化碳分压差(central venous-to-arterial carbon dioxide difference,Pcv-aCO2gap)为导向指导米力农干预脓毒症休克患者早期复苏治疗,明确其能否改善患者组织灌注,以期为脓毒症休克患者治疗提供新思路。方法:本研究为单中心、开放标签、随机临床试验。选取2020年12月至2
学位
<正>随着高中历史统编教材的投入使用,教学中新的问题和挑战开始出现,其中,如何提高课堂教学效率成为教师亟需解决的问题,笔者结合自身的教学实践,认为移情教学是一种值得尝试的方法。19世纪德国美学家弗列德里希·费肖尔认为移情是"人把他自己外射到或感入到自然界事物里去",以造成"对象的人化"[1],从历史教学的角度理解,"移情"是教师通过创设不同的情境,引领学生走近历史、感悟历史、体会历史、理解历史和解
期刊