结肠腺癌免疫相关基因预后模型构建和促进肺鳞癌转移的研究

来源 :广州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:EMPS
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
1.结肠腺癌免疫相关基因预后模型的构建目的:结肠腺癌(COAD)作为结直肠癌的主要病理类型,发病率和死亡率高。在这里,我们构建了免疫相关基因预后指数(IRGPI)来预测COAD患者的预后,该指标可作为筛查接受免疫检查点抑制剂治疗的患者的标准。方法:结合癌症基因组图谱(TCGA)和GSE39582数据集COAD样本的转录本和临床数据,以及Immport数据库和Innate DB数据库中的免疫相关基因,首先通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定COAD患者差异表达的免疫相关中心基因。然后,我们应用cox回归分析来确定与总生存率相关的免疫基因,并在此基础上构建IRGPI。比较IRGPI亚组的免疫细胞浸润、癌症异质性和免疫检查点表达。最后,我们使用GSE78220(n=27)数据集评估了IRGPI亚组在抗PD-1/PD-L1治疗中的应用。结果:IRGPI模型将TCGA数据集和GSE39582数据集中的COAD患者分为高危组和低危组,低危组预后较好。单因素和多因素Cox回归分析证实了IRGPI模型的可靠性。我们还发现,IRGPI低危组的一些细胞代谢受到明显抑制,CD4+T细胞的浸润也更多,肿瘤均一性增加,并且对抗PD-1/PD-L1治疗的反应有所改善。结论:IRGPI模型可用于预测COAD患者的预后,可用于抗PD-1/PD-L1治疗前的患者筛查。2.促进肺鳞癌转移的研究目的:肺癌往往在转移后才被确诊,我们旨在研究细胞型朊蛋白(Cellular Prion Protein,PrP)在人肺鳞癌H520细胞系中如何影响其迁移和侵袭能力,试图提供一个肺鳞癌的治疗靶点以抑制肿瘤的转移。方法:1)构建敲除PRNP基因的H520细胞的稳定细胞系KO3并检测。2)检测敲除PRNP后细胞表型的改变。为了排除基因脱靶效应,在PRNP缺失细胞中使用phage-PRNP质粒转入细胞以过表达外源PrP,并检测细胞表型是否能够恢复。3)通过免疫荧光实验观察PRNP基因缺失后,细胞骨架蛋白(F-actin表达水平)变化。4)使用RNA测序检测H520和KO3细胞迁移相关差异基因,并用real-time PCR验证上述差异基因。随后用对应抑制剂处理检测对应基因对细胞迁移和侵袭的影响。5)使用免疫印记检测H520和KO3细胞激酶的表达,用抑制剂处理后检测细胞迁移能力是否改变。6)为了建立激酶与筛选的差异基因的联系,我们采用免疫印记,real-time PCR等实验方法。结果:1)肺鳞癌高表达PrP,且预示着预后不良。2)在H520细胞中,PrP以Pro-PrP的形式存在并促进细胞的迁移和侵袭。3)Pro-PrP上调MMP9的m RNA水平,并促进迁移。4)Pro-PrP上调磷酸化ERK并促进迁移。5)Pro-PrP不能通过上调磷酸化ERK来调节MMP9的蛋白水平,可能与MMP9的酶活性有关,需进一步验证。结论:在人肺鳞癌H520细胞系中,细胞型朊蛋白PrP以Pro-PrP的形式存在并可通过影响p-ERK和MMP9来促进H520细胞的迁移和侵袭。p-ERK是否调节MMP9的活性还有待进一步研究。
其他文献
目的构建肝细胞肝癌ceRNA调控网络,探索肝细胞肝癌的发生发展机制,为肝细胞肝癌寻找新的治疗靶点及预后标志物。方法首先从TCGA数据库下载肿瘤表达数据、肿瘤突变数据及临床生存信息,使用perl语言对数据进行归一化处理,使用R语言筛选得到差异表达且与预后相关基因。接着使用R语言、GEPIA数据库及HPA数据库对目标基因进行多种肿瘤的表达分析及生存预后分析。用starbase数据库预测与目标基因结合的
学位
增值评价“为了发展而评价、借助评价促发展”的理念满足了新时代教育评价改革的核心诉求。研究结合济南市基础教育质量增值评价实践,提出了增值评价的价值意蕴,介绍了济南市的具体做法,讨论了影响增值评价赋能学校教育质量提升的关键要素,即区域支持的情景结构营造了有利于增值评价实施的政策环境和氛围,其效应往往间接产生;校长作为教师人际互动中的“重要他者”,其数据主导行为是重要推力;教师作为学校教育质量提升的核心
期刊
【研究背景】肾结石作为泌尿外科最常见的疾病之一,严重影响着患者的身心健康及生活质量。根据一项覆盖全国的尿石症横断面调查结果,我国成年人肾结石发病率高达5.8%。典型的肾结石发作时患者可出现肾绞痛、血尿、发热及呕吐等一系列症状,更甚者还表现为反复尿路感染和尿路梗阻,最终进展为肾衰竭。草酸钙结石作为肾结石中占比最高的类型,主要由高草酸尿这一代谢因素引起。为此探究草酸钙肾结石发生的病因和分子机制,寻找新
学位
党的干部是党和国家事业的中坚力量。干部队伍的整体素质体现党的领导水平和执政能力,事关党和国家事业的兴旺发达,事关人民安居乐业,事关国家长治久安。中国共产党肩负推进国家治理体系和治理能力现代化的重担,实现这一目标必须提高党自身的执政能力和领导水平。因此,必须建立专业化高素质的中国共产党干部队伍,选拔以德为先,德才兼备的好干部进入执政队伍。选拔党的干部必须树立大历史观,以史为鉴,从干部选拔历史中汲取智
学位
对于上市公司大股东来说,有时会有转让股份的需要。大股东通过既定的规则转让其持有的上市公司的股份,以此获得个人利益最大化,是无可厚非的。股东转让其持有的股份是其股东权利的一种体现。但是大股东为了谋取更多的利益,极有可能利用自身优势地位进行减持。大股东减持有一定的积极影响,比如可以减少上市公司股权集中程度,优化公司的内部治理,从而更好地保护中小投资者利益。但是通常情况下,大股东减持的消极影响更为明显。
学位
背景多种波长的激光被应用于辅助治疗种植体周围疾病,且大多数已被证明对种植体表面的净化具有积极作用。有研究报道激光处理会引起种植体表面粗糙度改变。种植体表面适度的粗糙度有利于增大表面积,促进成骨细胞黏附、分化,从而提高种植体周围骨整合率。在治疗中维持种植体表面适度的粗糙度对感染种植体再次骨整合具有重要意义。按照现有的经验使用激光时,是否改变种植体表面粗糙度从而影响后续软硬组织整合尚存在争议。目的通过
学位
【背景】因先天性疾病、肿瘤、炎症等原因引起的广泛气管狭窄在临床上十分常见,这种情况下需要行长段气管的切除和重建;然而大面积气管缺损的重建仍是一个尚未解决的问题。尽管经过了几十年的相关研究,但仍未找到结构可靠而功能可用的气管替代品。虽然目前已经有成功进行长段气管重建术的临床报道,但这些技术临床应用的可重复性和广泛适用性尚未实现。大型动物如狗、猪、绵羊和山羊的气管形态和生理与人类相似,这使它们成为探索
学位
黑龙江省是我国玉米产量最大的省份,由于气候条件的差异,黑龙江省玉米品种繁多。根据玉米用途,大致可分为食用玉米、饲用玉米、工业玉米。由于积温影响着玉米的生长发育过程以及各种营养物质的含量。可根据积温不同,提高玉米特定品质指标,以满足不同需求。黑龙江省共划分六条积温带,本文从积温带角度出发,探讨了黑龙江省玉米品质与积温带之间的关系以及合理安排作物生产区域对玉米品质提高具有重要意义。
期刊
背景多发性硬化(Multiple sclerosis,MS)是炎症性脱髓鞘疾病,发生在中枢神经系统(Central nervous system,CNS),是青壮年比较常见的非创伤性神经系统性疾病。氧化应激、线粒体功能障碍是MS疾病进展、组织损伤和脱髓鞘最为主要的原因。树突状细胞(Dendritic cells,DC)为最主要的抗原提呈细胞。其捕获抗原,提呈给T细胞,然后启动T细胞的免疫应答。DC
学位
背景牙周炎是一类以牙槽骨吸收、破骨细胞生成及活化为主要临床和病理改变的慢性溶骨性疾病,被认为是世界上第六大慢性感染性炎症。牙周支持组织的炎症及破坏会导致患者牙齿的松动脱落,影响患者美观及咀嚼,并且还和全身疾病息息相关,最终影响到人们的生活质量。目前对于牙周炎的治疗还是以药物激光等为辅,手术治疗为主,过程繁琐效果欠佳。而由巨噬细胞分化而来的破骨细胞是造成牙周炎牙槽骨吸收的主要细胞,所以如何抑制巨噬细
学位