褐藻多糖是一种分子量较高的水溶性杂多糖,存在于大型褐藻和一些海洋无脊椎动物的细胞壁中。它主要由硫酸化的L-岩藻糖（岩藻糖的2/3/4位羟基硫酸化）组成,一些还含有半乳糖、甘露糖、糖醛酸、葡萄糖、鼠李糖、木糖等单糖以及乙酰基等组分,其结构十分复杂。目前已知褐藻多糖有两种类型结构骨架,一种是只由α-（1,3）-岩藻糖苷键组成,另一种由α-（1,3）-和α-（1,4）-岩藻糖苷键交替组成。褐藻多糖具有广泛的生物活性,例如抗菌、抗氧化、抗肿瘤、抗炎、降脂等,可用作食品或食品添加剂、增稠剂等。这种纯天然的食品添加剂不仅营养丰富、安全无副作用,还成本低廉,所以具有广阔的市场和应用前景。由于褐藻多糖的结构复杂,并且缺乏针对其结构分析的工具——内切岩藻糖苷酶的酶学研究,不能精确地解析其降解产物的结构,因此其结构功能关系目前尚未完全阐明,也阻碍了其应用研究进展,为解决这一问题,我们在大肠杆菌中过表达来自海洋假交替单胞菌属（Alteromonas sp.）SN-1009的内切α（1→3）-岩藻糖苷酶Fdal的截短基因pJL25B,并对其进行了生化表征及活性分析。针对pJL25B活性分析,我们开发了基于MBTH（3-甲基-2-苯并噻唑啉酮氢酮）的分光光度法,成功地在最适pH 7.0、最适温度35℃和最适NaCl浓度1.0 M NaCl条件下检测到最高的活性,同时确定了其表观动力学参数Km和kcat为4.65 mg/ml和8.70 min-1。金属离子对酶活的影响研究发现,Fe3+和Mn²⁺分别使酶活提高了 100%和19.5%,Co²⁺和Cu²⁺使pJL25B完全失活,而Ni²⁺、Mg²⁺、Zn²⁺、Pb²⁺、Ca²⁺、Ba²⁺和 Li+分别使酶活降低了 58.8%、56.0%、50.6%、47.7%、28.9%、15.6%和 37.5%。通过与其他内切岩藻糖苷酶的结构和序列比对,预测了其潜在的催化残基,并通过定点突变进行了证实,然后提出了 pJL25B可能的催化机理。通过LC-ESI-MS/MS对pJL25B降解厚叶解蔓藻（Kjellmaniella crassifolia）的降解产物进行了表征,证实pJL25B属于内切-α（1→3）-岩藻糖苷酶。厚叶解蔓藻K.crassifolia岩藻聚糖的主要骨架是由1→3糖苷键连接的,而且它的结构很复杂。我们认为这种内切α-（1→3）-岩藻糖苷酶可用于阐明复杂岩藻聚糖的结构。