本论文从表型水平和DNA水平研究了中国永安糙花少穗竹（Oligostachyum scabriflorum）天然居群遗传多样性和遗传结构，并探讨了居群间的相互关系平和基因流。通过分析糙花少穗竹目前的遗传资源现状，提出合理的利用资源对策。研究结果如下： 1．选择13个表型性状，运用变异系数、巢式方差分析和分化系数研究亚居群间和亚居群内的表型变异。结果表明：糙花少穗竹亚居群内的变异大于亚居群间的变异，但表型的平均分化系数V_ST=37.29％，亚居群间的分化还是比较大的。表型性状与微环境因子间的相关分析表明：叶片性状与海拔相关极显著；株高与海拔相关显著；各表型性状与坡度、坡位间相关不显著；枝下高和胸径处节长与立地类型间相关显著；株高与乔木类型间相关显著。通过聚类分析发现，青水居群内的亚居群聚为一类，而安砂居群内的亚居群A5聚到洪田居群内，洪田居群内亚居群聚为2亚类。可能是人为干扰较为频繁所致。 2．用改良的CTAB法成功地从经干燥的糙花少穗竹叶片中提取出质量比较高的总DNA，完全满足RAPD的要求。 3．建立了糙花少穗竹RAPD分析的技术体系。反应终体积是20ul，Bufferl倍液，Mg²⁺2.0mM，Taq酶1U，引物0.5 uM，dNTPs0.1mM，DNA1ng/ul，用灭菌的双蒸水补齐。PCR循环程序如下：94℃预变性2min，然后94℃变性30second，38℃退火30second，72℃延伸90second，执行38个循环，最后72℃延伸7 min，以4℃结束。 4．利用RAPD标记，并以亚居群为基本单位对永安3个天然居群的遗传变异进行了研究。18个随机引物扩增出187条清晰且可重复的谱带，其中132条是多态的，分子量基本都分布在200bp到2800bp之间；物种水平的多态条带百分率为70.6％。Shannon多样性指数为0.4895，基因多样性（h）为0.3021，有效等位基因数（Ne）为1.4256，等位基因平均数（A）为1.8951；Popgene32计算出的糙花少穗竹3个居群的基因分化系数Gst为0.6809，基因流（Nm）为0.3078，TFPGA计算出的分化度Fst值为0.6908，利用Shannon多样性指数分析的居群间遗传多样性比例为（Hsp-Hpop）/Hsp=0.6824。这些结果表明糙花少穗竹天然居群内存在着丰富的遗传多样性，并且居群间的遗传分化较高；通过计算三个居群间的遗传距离和相似性显示，糙花少穗竹天然居群的遗传距离和空间距离之间存在相关性。