作为马科动物现存的唯一成员,马属动物有着悠久的发展历史,从所有马科动物的祖先始祖马的出现,到现在人们所看到的不同品种的家马,经历了漫长的演化过程。现今的马属动物主要由马亚属、驴亚属以及斑马亚属构成,大体上可分为caballine支系和非caballine支系,但在古代仍然生存着较多未知的马属动物,随着分子生物技术在动物考古领域的应用,人们发现了如Equus（Sussemionus）ovodovi这类独特的、已灭绝的马属动物。E.ovodovi是Equus（Sussemionus）亚属中的一员,这一亚属最早因其独特的牙齿特征在形态学上被划分出来,随后在对Equus（Sussemionus）亚属的形态学鉴定工作和分子生物学研究中,将E.ovodovi确定为Equus（Sussemionus）亚属下的一个独立的种。中国北方地区对于“马”的文字记载可早至夏商,在陕北地区也出土了年代较早的马骨,许多学者推论龙山时期可能出现了家马,但这一时期出土的马骨能否确定为家马,尚缺乏样本和数据支撑。考古资料显示,殷商之后的车马坑多见马骨出土,然而目前出土的新石器时期马骨相对较少,这一“缺环”正是家马起源研究的重要节点。陕西靖边庙梁遗址是陕北地区一处新石器时期遗址,年代涵盖仰韶、龙山时代。庙梁遗址的房址以及灰坑中出土了较多古代马属动物的骨骼,经形态学分析,这些马属动物骨骼不能准确地判定为家马,为进一步确定其种属,我们选取其中17例样本进行分子考古学研究,这些马骨样本包含的古DNA信息,可为研究早期家马的起源和传播问题提供有益信息。本研究提取了17个庙梁遗址马骨样本的线粒体全基因组,结合中国北方地区三个遗址（洪河遗址、木柱柱梁遗址、沙塘北塬遗址）中出土的距今四千年左右马骨样本的线粒体序列,分别使用马和驴作为参考基因组进行系统发育分析、主成分分析以及中介网络图等分析。分析结果显示,庙梁遗址出土的马属动物并不是家马,而是现已灭绝的野生马属动物E.ovodovi。E.ovodovi群体与马的遗传关系较远,与驴和斑马的遗传关系较近,并且比驴和斑马支系更早分化出来,拥有古老、独立的母系祖先。E.ovodovi群体内部大致分为两个主要分支,一支以陕西地区的群体为主（EOV1）;另一支以黑龙江及西伯利亚地区的群体为主（EOV2）,在这一分支中,洪河遗址群体（EOV2a）与年代较早的更新世时期的群体（EOV2b）也出现了分化现象。目前缺乏内蒙古地区E.ovodovi样本序列,E.ovodovi群体内部基因交流、扩散途径等相关问题尚待进一步研究。通过对庙梁遗址出土马骨样本的分子考古学研究,结合洪河遗址、木柱柱梁遗址、沙塘北塬遗址出土的距今四千年左右的马属动物样本序列,发现其并不是家马,而是未经驯化的野马,这说明有必要对龙山时期出土的古代马属动物遗骸开展形态学分析和分子考古学研究,为中国家马的起源提供更多线索。