建立新型农村合作医疗制度是保障农民健康，解决“三农”问题，统筹城乡和经济社会协调发展，全面建设小康社会的重要举措。在建立新型农村合作医疗的过程中，基金的筹集问题又是重中之重。如何加强基金的筹集与管理工作，这不仅是一个复杂的理论问题，也是一个严峻的现实问题。本文通过调查研究、文献研究、统计分析等方法，探讨新型农村合作医疗基金筹集与管理存在的问题，提出相应的解决办法与对策，力求能对新型农村合作医疗的基金的筹集与管理提出政策性强、可操作性强的建议。 论文的第一部分就研究的意义及目的进行了阐述，介绍了研究的主要方法，并对目前新型农村合作医疗的研究现状进行了详细的述评。目前，对新型农村合作医疗的研究大多集中在补偿模式、政府责任、基金筹集困难等问题的研究，而对基金筹集模式、管理及监督等方面研究较少。 第二部分，从初步形成、迅速推广、解体及重建四个阶段介绍了新型农村合作医疗的制度变迁，详细地剖析了新型农村合作医疗基金在筹集、管理及监督上存在的问题，并对其背景原因进行了分析。由于政策不稳定、政府投入有限、筹资主体不明确、筹资标准偏低等原因，新型农村合作医疗的基金筹集很难得到保证。加上通货膨胀的侵袭，投资回报率低，以及管理上存在严重的问题，基金难以达到解决农民医疗困难的目的。因此，急需加强对新型农村合作医疗的基金的管理及监督。 第三部分，通过简单的数理模型，分析相关的数据，从而对新型农村合作医疗的筹集标准进行重新界定。经本文研究认为，新型农村合作医疗的筹资标准偏低，应适当提高。同时本文强调，有条件的地方应当逐步过渡到强制征集的方式，以保障新型农村合作医疗基金的来源。对于没有能力承担新型农村合作医疗缴费的农户，应由政府代为缴纳，或将其纳入医疗救助的范围。新型农村合作医疗制度应采取个人账户与统筹账户相结合的方式。个人账户用于一般的门诊治疗，而统筹账户用于支付住院费用。完善新型农村合作医疗的筹资必须明确新型农村合作医疗的筹资主体，出台完善的法律制度，同时还必须加强宣传工作。 第四部分，具体阐述了如何完善新型农村合作医疗基金的管理。文章通过对国外基金管理方式的研究，认为加强新型农村合作医疗基金的投资，需确立中央政府部门和各省、自治区、直辖市政府部门为宏观管理单位，县级及县级以下政府部门为新型农村合作医疗制度的直接主管部门，以加强基金投资，确保基金正常运营，并对支付方式进行合理的组合，确立更科学的报销方式，从而消除报销危机。 第五部分借鉴国外对医疗保障基金的监督办法，提出应当加强新型农村合作医疗基金的内部监管及外部监管。新型农村合作医疗基金的内部治理结构应做到：基金重大战略、计划及决策制定和基金业务活动的执行相分离；业务活动和监督评价相分离。新型农村合作医疗的外部监管，主要包括行政部门监督、专门部门监督和社会监督。