目的:分析潮汕地区眼部感染性疾病病原菌分布及抗菌药物耐药情况,研究二代宏基因组学技术（m NGS）在感染性眼内炎患者眼内液病原微生物检测的价值,为感染性眼内炎患者的临床治疗提供参考。方法:对2011年-2021年在汕头大学·香港中文大学联合汕头国际眼科中心诊断为眼部感染性疾病的微生物送检标本分离培养结果进行回顾性分析,分析培养阳性率、菌群种属分布及耐药变化。对2020年5月至2021年9月在临床确诊为感染性眼内炎的36例患眼在行玻璃体切除手术时取玻璃体液或前房水,同时进行传统的细菌真菌培养联合药敏试验和二代宏基因测序（m NGS）,比较两种检测方法的阳性率及检测结果的一致性。结果:传统的细菌分离培养方法共分离出病原菌522株,细菌培养的阳性率为31.77%,其中革兰阳性菌为312株,占59.77%;革兰阴性菌为160株,占30.65%;真菌为50株,占9.58%;表皮葡萄球菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、粪肠球菌、枯草杆菌和溶血葡萄球菌为排名前6位的病原菌,占比分别为31.80%、10.15%、5.56%、4.21%、3.07%和2.87%;表皮葡萄球菌对左氧氟沙星、莫西沙星、利福平、庆大霉素和万古霉素等临床常用抗菌药物有较好的敏感性,但是左氧氟沙星和莫西沙星的耐药率明显升高;铜绿假单胞菌株对美罗培南、亚胺培南、头孢吡肟、头孢他啶、哌拉西林/他唑巴坦等均敏感,对氨基糖苷类抗菌药物和氟喹诺酮类抗菌药物的耐药率也较低。m NGS检测出病原微生物前6位分别为表皮葡萄球菌、肺炎链球菌、肺炎克雷伯菌、粪肠球菌、缓症链球菌、阿氏肠杆菌;覆盖度前6位病原微生物分别为肺炎克雷伯菌、肺炎链球菌、副血链球菌、痤疮丙酸杆菌、表皮葡萄球菌、缓症链球菌。mNGS和微生物培养的阳性率分别为88.89%（32/36）和27.78%（10/36）,两种方法比较的差异具有统计学意义（χ~2=27.657,P＜0.01）。外伤性眼内炎、手术后眼内炎及内源性眼内炎最常见的病原菌分别是表皮葡萄球菌、肺炎链球菌和肺炎克雷伯菌。在微生物培养阳性的病例中,m NGS和微生物培养的一致性为70%。m NGS共在9个病例中检出耐药基因。患者的最终视力与微生物序列数之间存在临界相关性（r=0.498,P=0.05）。结论:表皮葡萄球菌和铜绿假单胞菌为眼部感染主要病原菌,其对氨基糖苷类及氟喹诺酮类抗菌药物耐药率较低,但是表皮葡萄球菌对左氧氟沙星耐药率明显升高,应该引起临床重视。与微生物培养相比,m NGS对感染性眼内炎患者致病菌检测的阳性率更高,m NGS还能提供抗菌药物耐药信息,感染性眼内炎患者的病程和术前视力能预测终末视力,微生物序列数与终末视力有边缘相关性。然而,部分mNGS的检测结果与培养结果不一致的问题需要进一步验证。