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欧文氏菌(Erwinia)是一类重要的植物致病菌,侵染宿主范围广,在世界范围内造成了严重的经济损失。欧文氏菌属(Erwinia)主要包括胡萝卜软腐欧文氏菌胡萝卜软腐亚种(Erwinia carotovora subsp. carotovora,简称Ecc),胡萝卜软腐欧文氏菌黑胫亚种(Erwinia carotovora subsp. atroseptica,简称Eca)和菊欧氏菌(Erwinia chrysanthemi,简称Ech)三个亚种。Bell等人于2004年测出了导致马铃薯黑腐病的致病菌株Eca SCRI1043基因组。它由一条环状染色体组成,无质粒,基因组G+C含量为50.97%。本研究以全基因组测序的胡萝卜软腐欧文氏菌SCRI1043株(Eca SCRI1043)为研究对象,构建胡萝卜软腐欧文氏菌的代谢网络,利用网络拓扑结构和流量平衡分析确定几种处于网络重要节点位置、代谢通量不为零,并且在宿主植物中不存在同源蛋白的酶作为最优作用靶标；然后在商品化合物数据库Specs中通过分子对接和高通量虚拟筛选的方法筛选的针对靶标的活性化合物。本研究的目的是为了筛选有进一步开发价值的新型杀菌化合物,为研制具有自主知识产权的新型绿色杀菌剂奠定基础。本研究的主要内容与结果如下：(1)运用代谢网络重构工具MODEL SEED构建了胡萝卜软腐欧文氏菌(Eca SCRI1043)的代谢网络,并对其进行了反应方向的修正和通用代谢物剔除。利用反应方程式的关联方式在cytoscape中实现了代谢网络的可视化,并对代谢网络进行分析,表明该代谢网络模型也符合代谢网络典型的“小世界”和“无标度”特征。(2)利用构建的胡萝卜软腐欧文氏菌的代谢网络进行了网络拓扑结构分析,筛选出网络的中心节点。并对这些中心节点的酶蛋白序列与TTD靶标数据库中的己知靶标作序列比对,筛选到了44个胡萝卜软腐欧文氏菌的潜在靶标。随后对这些靶标用流平衡分析(FBA)的方法进行验证,得到了6个靶标。最后,考虑这些靶标的生物功能以及对宿主植物的同源性,选取了十一异戊二烯焦磷酸酶(Upps)作为靶标进行下一步的农用杀菌活性化合物的筛选工作。(3)对靶标Upps用同源模建的方法构建了三维结构并进行了优化。对模建结果用软件PROCHECK进行了评价,结果表明模建的结果结构合理。最后,以specs公司的商品化合物数据库Specs作为小分子数据库,对靶标进行了高通量虚拟筛选,对打分结果最好的前400个化合物进行人工目筛,得到了73种·hit化合物,这73种化合物可以作进一步的后续生测实验以确定其杀菌活性。