鲚属(Coilia)是鲱形目(Clupeiformes)、鳀科(Engraulidae)的一群中小型鱼类,一般认为有13种,分布于太平洋中西部至印度洋沿岸水域。鲚属的多数种类生活在沿海水域,并具有明显的在沿海与河口间短距离洄游的习性,只有分布于越南的(C. lindmani)和长江的短颌鲚(C. brachygnathus)等少数种为纯淡水种类。早先认为鲚属在中国有4种,即凤鲚(C. mystus)、七丝鲚(C. grayii)、刀鲚(C. nasus)和短颌鲚(C. brachygnathus)。刀鲚平时生活在中国、日本和朝鲜沿海,春季性成熟后从河口溯江而上进入江、湖中产卵繁殖,孵化后的幼鱼随水返海肥育。但在长江下游的太湖、巢湖等湖泊中,生活着一种在形态和生活习性上与洄游型有一定差异的淡水定居型种群,即湖鲚(C. nasus taihuensis),作为刀鲚的一个亚种。但随后依据外部形态、矢耳石形态、同工酶、mtDNA控制区和cyt b基因等特征所作的分析,认为湖鲚尚未达到亚种水平。同时,一直被视为刀鲚近缘种的短颌鲚的物种有效性也被质疑。近年依据形态、生化、mtDNA等特征的比较研究,短颌鲚也被认为是刀鲚的一个淡水定居型种群。因此,现有研究已基本澄清长江刀鲚具有2个生态类型的种群或生态型(ecotype),一类为淡水定居,包括湖鲚和短颌鲚;另一类为洄游,也即以前的刀鲚。虽然上颌骨长和臀鳍条数一直认为是刀鲚区别于湖鲚和短颌鲚的主要特征,但以前并没有对这些特征进行过大样本的比较。鱼类矢耳石由于具有保守的形态和元素组成而被广泛用于近缘种鉴别和种群识别。本文依据2009年4月至2009年11月采集了靖江、九段沙、太湖、鄱阳湖等地,采集了906尾标本,采用先进的数码x光拍照手段,对4个代表性种群的上颌骨长、臀鳍条数和脊椎骨数以及矢耳石进行了测量和分析,以明晰长江刀鲚不同生态型间的这些表型差异。主要结果如下:1、单因素方差分析显示,上颌骨长/头长,表现出在同一生态型内差异不显著,而不同生态型间差异极的显著现象。靖江、九段沙种群分别与定居型种群差异极显著。太湖、鄱阳湖种群间此性状差异极显著。2、分析统计了4个地理种群906尾标本的X光图片,同一个种群中,刀鲚脊椎骨数和臀鳍鳍条数变动幅度也很大,基本呈现出正态型分布现象。虽然两者在种群间的重叠较多,但由靖江和九段沙种群组成洄游型与由太湖、鄱阳湖种群组成的定居型间,脊椎骨平均值的差异极显著。臀鳍至尾鳍间脊椎骨数差异极显著。3、用4个刀鲚地理种群的上颌骨长/体长、上颌骨长/头长、脊椎骨数、臀鳍鳍条数、这4个性状作聚类分析并绘制树形图,显示出在同一生态型内欧氏距离很小,不同生态型间欧氏距离平方较大的现象。树形图显示可见靖江与九段沙,以及太湖与鄱阳湖种群各可合为一个组群,且2个组群的关系较远。4、用上述4个性状建立Bayes判别函数并进行逐步判别,结果显示423尾洄游种群的判别成功率为92.9%,263尾太湖种群的判别成功率为92.8%,220尾鄱阳湖种群的判别成功率为99.5%。这表明这些特征也能有效区别不同的生态型或地理种群。5、通过对上述四种群122尾标本矢耳石9种形状指标的单因素方差分析表明,靖江、九段沙种群无显著性差异。洄游与定居生态型种群在圆度、椭圆率、半径比、Feret比和幅形比这几个矢耳石形状指标方面存在显著性差异。靖江、九段沙种群刀鲚矢耳石轮廓比较规则,鄱阳湖种群其次,太湖种群轮廓最不规则。九段沙、靖江种群次之,鄱阳湖种群刀鲚矢耳石最不趋近圆。鄱阳湖种群刀鲚矢耳石最厚,靖江、九段沙种群值次之,太湖种群刀鲚矢耳石最薄。根据矢耳石形状指标所作主成分分析结果显示,前1,2主成分累积贡献率为84.642%,可以用少量地概括4个刀鲚地理种群矢耳石形态差异。对上述9个矢耳石形状指标的逐步判别结果显示在4个刀鲚地理种群的122尾个体中, 62尾洄游种群的判别成功率为88.71%,29尾太湖种群的判别成功率为93.1%,30尾鄱阳湖种群的判别成功率为96.67%。表明矢耳石形状指标能有效区别不同的生态型或地理种群。