黑腐病是危害十字花科作物的主要病害之一,在世界范围内流行较广。在生产上多以化学防治为主,大量使用化学农药对环境和生态造成了极大的破坏,生产实践表明培育抗病性品种是预防十字花科黑腐病经济、安全、且有效的途径。研究当地优势菌群,分析病原菌与寄主的互作关系,筛选寄主靶标蛋白,可以合理布局甘蓝的种植及多抗黑腐病品种的选育。本研究通过野油菜黄单胞菌和感黑腐病甘蓝为试材,对国内甘蓝主产区分离到的黑腐病菌进行了基因组测序和遗传多样性分析。通过全基因组比较分析选择了Ⅲ型效应因子Xop R。利用构建的甘蓝c DNA文库筛选出了与效应蛋白Xop R互作的靶标蛋白,为阐明病原菌与植物互作机制奠定基础,及抗黑腐病甘蓝育种提供新的思路。主要研究结果如下:（1）对中国9个不同省市的甘蓝主产区进行了黑腐病菌的分离及鉴定。利用分子生物学手段对菌株进行分型,将国内黑腐病菌分为以北京四季青菌株、甘肃新添镇菌株和race1菌株为代表的三个亚群,其中北京四季青菌株分布范围最广,甘肃新添镇菌株毒性最强。（2）在全基因组测序的基础上,整合前人研究的从属到种的分子标记,开发出了北京四季青菌株和甘肃新添镇菌株特异性分子标记,可快速地鉴定不同地区田间黑腐病菌株。（3）全基因组分析表明,北京四季青菌株和甘肃新添镇菌株分别有26和47个插入位点,这些位点分别包含6个和10个毒力相关致病因子。对北京四季青菌株和甘肃新添镇菌株的毒力因子（T3SS、LPS和EPS）分析表明,不同菌株之间存在基因核苷酸差异。进化树分析表明北京四季青菌株与MAFF 302021菌株在亲缘关系上较近,甘肃新添镇菌株与race2（HRIW 3849A）菌株较近。（4）序列分析表明基因Xop R是一个高度保守的Ⅲ型效应因子。为了研究Xop R功能,分别构建了缺失突变体ΔXop R和过表达载体p YBA1144/Xop R。甘蓝致病力比较发现ΔXop R比HRIW 3811野生菌株致病力弱,过表达p YBA1144/Xop R农杆菌注射烟草发现Xop R可抑制BAX引起的细胞死亡。（5）利用感病甘蓝cDNA文库筛选到与Xop R互作靶标蛋白Bo SGR1,利用酵母双杂交、亚细胞定位和双分子荧光互补试验证实Xop R与Bo SGR1互作,通过q RT-PCR分析表明Bo SGR1可受到黑腐病菌、水杨酸、茉莉酸甲酯和乙烯利诱导。Bo SGR1基因沉默可增加甘蓝黑腐病抗性,过表达拟南芥则对黑腐病更加感病。Bo SGR1在甘蓝上是一个感病基因,可以作为抗病育种的一个新靶点。