马铃薯疮痂病菌(Streptomyces galilaeus)的细胞壁降解酶及其致病机制研究

来源 :甘肃农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bingke111888
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
疮痂病是马铃薯的主要土传病害之一,在马铃薯主产区发生普遍且危害程度逐年加重,严重影响马铃薯产业的可持续发展。本研究以疮痂病菌Streptomyces galilaeus 5T-1为研究对象,研究产生细胞壁降解酶种类、关键致病酶对寄主防御酶系的影响及果胶对疮痂病菌5T-1代谢的影响,利用转录组测序技术分析疮痂病菌5T-1侵染过程中基因的差异表达,并对糖苷水解酶基因CP966_RS01990进行了克隆、原核表达纯化及致病功能验证。主要研究结果如下:1、不同底物诱导疮痂病菌5T-1可产生纤维素酶(Cellulase,Cx)和聚甲基半乳糖醛酸酶(Polymethylgalacturonase,PMG),并且PMG(17.79 U/m L)酶活性高于Cx(9.04 U/m L);罹病马铃薯组织可产生β-葡萄糖苷酶(β-D-Glucosidase,β-GLU)、Cx和PMG,其中β-GLU酶活性较高,为17.61 U/m L,其次是Cx(14.09U/m L)和PMG(7.72 U/m L);疮痂病菌5T-1与不同马铃薯组织互作过程中能引起不同马铃薯组织(薯肉和薯皮)发生一定程度的褐变和软化,可产生Cx、β-GLU和PMG,其中薯肉产Cx酶活力呈现下降-上升-下降趋势,在0 h达到最大,为27.19 U/m L,薯皮产Cx酶活力呈先上升后下降再上升的动态变化,分别在24 h和96 h出现两次峰值(7.29 U/m L,9.42 U/m L);薯肉和薯皮产β-GLU酶活力均呈现上升-下降-上升-下降趋势,分别在48 h和24 h达到最大,为4.59 U/m L和7.13 U/m L;薯肉产PMG酶活力呈上升趋势,在144 h的达到7.77 U/m L,薯皮产PMG酶活力呈先上升后下降再上升的动态变化,在第144 h出现最大值,为12.87 U/m L。以上结果说明疮痂病菌5T-1离体及侵染组织均能产生Cx和PMG,且与不同组织互作过程中变化动态存在差异,其中PMG主要作用于互作后期。2、影响Cx和PMG酶活力的因素由大到小依次为培养基初始p H>培养时间>温度>转速,同时可知各因素的Cx产酶优化条件组合为培养时间8 d,培养温度23℃,培养基初始p H 5,转速200 rpm,并且在最佳产酶条件下疮痂病菌5T-1产生Cx的酶活力为30.47±3.69 U/m L。PMG产酶优化条件组合为培养时间6 d,培养温度23℃,培养基初始p H 5,转速200 rpm,并且在最佳产酶条件下疮痂病菌5T-1产生PMG的酶活力为42.19±0.56 U/m L。在此条件下,从疮痂病菌5T-1中提取的Cx和PMG粗酶液均能促进萝卜种子发芽,发芽率分别提高12.69%和5%,但均可抑制萝卜幼苗生长,株高分别降低50.72%和69.52%,并且使萝卜幼苗根和叶发生病变,发病率分别为92.86%和96.43%,说明疮痂病菌5T-1能够产生对植物具有抑制生长和致病作用的Cx和PMG,并且PMG的致病力强于Cx。另外,疮痂病菌5T-1产生的PMG能够诱导马铃薯过氧化物酶、多酚氧化酶、苯丙氨酸解氨酶、过氧化氢酶和超氧化物歧化酶的活性提高25.48%-161.05%,且差异显著,表明PMG还可以激发寄主植物的防御反应。3、采用层次聚类法从果胶诱导疮痂病菌5T-1的代谢产物中共筛选出148种差异代谢物,其中84种代谢物表达量显著上升,关键代谢产物主要有L-色氨酸、L-高苯丙氨酸、2-氨基己二酸、3-羟邻氨基苯甲酸、芳香醇、亚胺甲基谷氨酸和N-甲酰基-L-谷氨酸、3-酰脲丙酸、4-氨基丁酸乙酯等;这些物质可能参与疮痂病菌5T-1合成并分泌致病果胶酶且在侵染马铃薯时对细胞壁果胶成分起降解作用。经KEGG通路富集分析,有代谢通路、β-丙氨酸代谢、嘌呤代谢、泛酸盐和Co A生物合成共4条通路影响显著。4、疮痂病菌5T-1在侵染24 h、48 h和96 h时分别出现1319、2853和3632个差异表达基因,且各时间段的上调表达基因分别富集到76、80和80个KEGG通路中,包括ABC转运蛋白、群体感应、碳代谢、三羧酸循环、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、氨基酸的生物合成和半乳糖代谢等,发现了341个转录因子家族参与了疮痂病菌的致病过程,并筛选到80个与CAZyme相关的上调表达基因,其中糖苷水解酶家族和糖基转移酶家族基因占比最高,均为35%;最终确定了20个在疮痂病菌5T-1侵染致病过程中可能起到关键致病酶作用的纤维素酶和果胶酶家族基因。5、通过克隆疮痂病菌5T-1侵染过程显著上调表达的糖苷水解酶基因CP966_RS01990,该基因具有GH53基因家族保守域,编码519个氨基酸,分子量约为54.97 k Da,属亲水性蛋白,信号肽切割位点为31-32位氨基酸之间,无跨膜结构,亚细胞定位于胞外,且编码的蛋白具有29.67%的α螺旋,21.97%的延伸,7.32%β折叠,41.04%的无规则卷曲构成二级结构和三级结构。构建原核表达载体p ET28a-CP966_RS01990,在大肠杆菌BL21(DE3)中成功表达重组蛋白,His标签纯化获得该重组蛋白,并且该重组蛋白对萝卜幼苗具有生长抑制作用和致病功能,使萝卜幼苗的株高降低了74.60%且发病率达97.78%。本研究基于酶学、代谢组学和转录组学等初步探明了疮痂病菌5T-1在离体、活体条件下产生PMG和Cx,并且鉴定了该菌响应果胶诱导和与寄主互作时的代谢通路、关键代谢产物、关键致病酶基因,克隆了糖苷水解酶基因CP966_RS01990并验证了其编码蛋白的致病性,揭示了疮痂病菌5T-1细胞壁降解酶的致病机制,系首次证实细胞壁降解酶PMG和Cx是马铃薯疮痂病菌的主要致病因子之一。
其他文献
减少农田水土流失并合理利用水土资源是当今世界面临的严峻挑战,尤其干旱半干旱生态脆弱区,土壤风蚀效应显著、水资源短缺严重,亟需构建科学的水土保持方案以提高土壤抗蚀性及节水潜力。农田土壤耕作及水肥管理可改变土壤抗蚀性、水分贮蓄及生产力状况,但前茬作物覆膜免耕抗风蚀及其与水氮互作对后茬作物土壤节水效应的调控机制尚不明确。为此,本研究于2019-2020年,在河西绿洲灌区以前茬覆膜玉米免耕(NT)和翻耕(
学位
蓟马是影响我国西北地区紫花苜蓿产量与营养价值的主要生物胁迫因子。研究不同抗蓟马苜蓿品种响应蓟马为害的生理及分子变化特征,进一步阐明紫花苜蓿抗蓟马的防御机制,可为抗蓟马苜蓿种质创新奠定基础。本研究以抗蓟马苜蓿品种甘农9号(G9)、感蓟马苜蓿品种甘农3号(G3)和高感蓟马苜蓿品种WL363HQ(W3)为试验材料,研究苜蓿苗期蓟马数量(0(CK)、3、5、7、9头/枝条)和为害时间(0 h、48 h、7
学位
粉红单端孢(Trichothecium roseum)是重要的采后病原真菌,可侵染苹果、甜瓜、番茄等多种果蔬。除了导致采后损失和品质劣变外,T.roseum还会在寄主体内产生毒素,造成潜在的安全隐患。本文首先观察T.roseum的基本生物学特性,在对该病原菌进行全基因组测序的基础上,选择p H信号通路转录因子PacC和活性氧产生关键酶NADPH氧化酶进行生物信息学分析;通过构建Tr PacC、Tr
学位
土壤盐渍化和干旱是世界范围内限制作物生长和农业生产的主要因素。多数农作物由于生长在优裕的管理条件下,其抗逆性的遗传潜力十分有限。荒漠植物对极端生境良好的适应性使其进化出了独特的抗逆机制,蕴含着丰富的抗逆基因资源,具有重要的研究价值。唐古特白刺(Nitraria tangutorum Bobr.)隶属于蒺藜科(Zygophyllaceae)白刺属(Nitraria L.),广泛分布于我国西北荒漠干旱
学位
随着全球极端高温天气常发和畜禽集约化养殖的快速发展,热应激给人类健康和畜禽养殖业带来极大威胁。肝脏损伤是热应激造成机体损伤的常见并发症。生脉散(Sheng Mai San,SMS)是中(兽)医益气养阴生脉之代表方剂,对缓解热应激造成的机体损伤具有良好的疗效,但其治疗热应激造成肝脏损伤的报道较少,具体作用机制尚不清楚。本研究以生脉散为研究对象,通过建立体内外热应激致大鼠肝脏损伤模型,系统评价了生脉散
学位
马铃薯是世界第三大粮食作物,就产量而言,仅排在水稻和小麦之后。由于马铃薯较浅的根系,其生长极易受到干旱胁迫的影响。植物在长期的进化过程中,形成了多种响应干旱胁迫机制。染色质结构在调控基因表达过程中起着重要作用,转录因子结合顺式作用元件通常与染色质可及性区域相关。植物转录因子或其它调控蛋白结合的基因组区域,被认为是核小体缺失或者核小体动态改变的区域。ATAC-seq技术已成功运用到植物全基因组水平染
学位
第二信使之一的Ca2+广泛存在于细胞内,它可以接收并且整合包括生物和非生物对植物产生的各种信号,调节各种生化反应。钙调磷酸酶B类蛋白(Calcineurin B-like protein,CBLs)是钙信号感受器的一种,与其特异性互作蛋白CIPK(CBLs-interacting protein kinases)相互作用形成复合体。CBL-CIPK复合体磷酸化下游蛋白质,或者直接与下游的蛋白质相互
学位
河西绿洲冷凉灌区水资源短缺和传统漫灌方式严重制约该区农业可持续发展。为突破瓶颈,通过引入膜下滴灌调亏灌溉模式,可实现该区作物节水、稳产、提质的目标。本研究于2019和2020年4~10月在甘肃省张掖市民乐县洪水河管理处益民灌溉试验站进行。供试材料品种为―青薯168‖,根据马铃薯不同生育期及《灌溉试验规范》(SL 13-2015),共设计了8个调亏灌溉处理和1个充分灌溉对照,分别为:苗期调亏灌溉(W
学位
全面从严治党作为党的建设伟大工程的重要内容,是党在新的历史条件下应对新挑战的必然选择,而治国理政的实际需求、人民的美好生活要求也需要通过全面从严治党来实现,这也是全面从严治党的逻辑进路。全面从严治党的核心是加强党的领导,基础在全面,关键在严,要害在治,必须正确认识全面从严治党的科学内涵,才能使党保持强劲的领导力、组织力和公信力,从而进一步夯实党的执政基础。
期刊
农光互补是设施农业发展的重要方向,但节能日光温室受自身结构限制,在与大尺寸光伏板集成中存在突出的“争光”矛盾。为解决这一问题,本文以设施农业生产需求为导向对光伏集成形式进行优化,从模型分析与应用仿真的角度对此开展研究:1.构建天穹采光模型。通过文献研究挖掘出“天气类型”“天穹高度(云底高度)”“天空背景亮度”三者之间的关系:晴朗天气云底高度8000m,太阳所在区域天空背景亮度Esu n是非日面区天
学位