近十年来，我国公益事业发展迅猛，随之凸显的公益组织财务问题引人深思，可以说，我国公益组织的财务透明度整体不高，整个公益环境不透明，这不仅极大的损害了广大捐赠者的捐赠热情与公益信心，也是对公益组织自我发展的扼杀。发展公募基金会要求其必须提高财务透明度，主动公开组织财务信息，便于公众对组织受托责任进行评价与监督，保护捐赠者利益，同时这也是对组织自身发展的保障，是未来发展的趋势。本文在综述国内外有关透明度研究成果的基础上，从高透明度信息的基本要求出发，以公募基金会为例，设计了测度公募基金会财务透明度的指标体系。其中选取2006年至2011年在民政部登记的公募基金会为样本，收集包括基金会官网以及公募基金会自建网站上披露的信息数据，建立模型验证了相关研究中关于财务透明度应该包含非财务信息和财务信息的理论，得出测度公募基金会财务透明度必须包括信息披露和财务绩效两大模块的结论，能够完整地概括财务透明度应该达到的数量标准和质量标准。然后，本文运用熵值法对2011年民政部登记的公募基金会进行财务透明度测度并综合测度，发现目前我国公募基金会财务透明度普遍不高，尤其在财务绩效模块方面表现得参差不齐。最后，根据对公募基金会综合评价的结果，对公募基金会提出了完善财务信息公开披露的网络途径和建立健全内部监督制度及反馈体系的建议，对相关监管部门提出建立财务透明档案的政策意见。