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家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori Nuclear Polyhedmsis Virus，NPV)是昆虫病毒史上首先发现的，世界养蚕国家每年由NPV病引起的蚕茧损失是巨大的。BmNPV病毒基因组已经解析，家蚕抗BmNPV的分子标记以及mRNA差异显示分析也有报道，但是从蛋白质组水平研究工作尚未开展。
本研究以家蚕抗BmNPV品系、感性品系以及近等基因系为材料，通过二维电泳和质谱技术联用的方法，对家蚕中肠、血液、脂肪体进行抗BmNPV差异蛋白质组研究。同时，也研究了BmNPV蛋白质表达谱和蛋白鉴定。其结果如下：
1、在五龄起蚕第10小时和第18小时的血淋巴液中共分离出19种差异蛋白。其中在第10小时中找到了9种差异蛋白，抗性品系中表达量高于感性品系的蛋白有：富含半胱氨酸的分泌型酸性蛋白，Rab family GTPase，Mod(mdg4)-heS00531，ALY，仅在感性品系中发现的蛋白有phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 和putative transposase yabusame-W。在第18小时中找到了5种差异蛋白，抗性品系中表达量高于感性品系的蛋白有：β-1，3-葡聚糖识别蛋白，酚氧化酶，而羟脯氨酸异构酶，溶酶体硫醇还原酶IP30前体1型是只在306和BC8两个品种中有，而在NB品种中没有明显表达。有意义的是在两个时间段里，氨基酰化酶只特异在抗性品系中表达。
2、在家蚕中肠中共分离出14种差异蛋白。其中在不添食BmNPV病毒的三个品系的表达图谱中共获得9种差异蛋白。抗性品系中特有的为：beta-glucosidase，protein disulfide isomerase，heat shock 70 kD protein cognate，tropomyosin isoform 1和serpin-2。而juvenile hormone diol kinase和calponin/transgelin是感性品系所特有的。在添食BmNPV病毒的三品系中获得了5种差异蛋白，其中抗性的表达量要高于感性品系的蛋白别为：similar to CG11267.PA，核糖体蛋白，bolA-like 3，脂肪酸结合蛋白(fatty acid binding protein)和翻译起始因子(translation initiation factor 5A)。
3、在家蚕脂肪体中共分离出20种差异蛋白。在不添食BmNPV病毒的三个品系中得出9种差异蛋白。在抗性品系中有的分别为：tropomyosin isoform 6，pol polyprotein，GA16543 gene product fromtranscript GA16543-RA，similar to bicaudal CG3644-PA，isoform A，Phosphoglycerate kinase(PGK)和arginine kinase。同时也发现在感性品系和近等基因系上存在的而在抗性品系NB上没有的蛋白点是heat shock cognate protein和glutathione S-transferase 2。另外在添食BmNPV病毒的三个品系中得出10种差异蛋白，其中9个是存在抗性品系中，分别为：reverse transcriptase，heat shock cognate protein，tropomyosin isoform 5，protein disulfide isomerase，ribosomal protein L21，Annexin IX-A，Protein of unknown function(DUF1676)和Actin3。，另外1种是感性品系和近等基因系BC8中发现的分别为：Troponin。
4、鉴定了BmNPV病毒(ODV)中的20种蛋白。分别是：Polyhedrin，BmNPV off133，Pk2，Bro-e，IE-0，VP80，BmNPV orf87，BmNPV orf94，DNA polymerase Helicase，GP41，VP39，IE1，Lef3，Lef2，P91，ODV-E56，P74，25k protein，Lef1和P74，有趣的是在凝胶图上获得了21个GP41的蛋白点，9个VP39的蛋白点。这些蛋白点在胶上无规则分布，有着不同的pI值和分子量。