中华鳖免疫相关基因的筛选、克隆及表达分析

来源 :中国科学院水生生物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kkkwwwbushiwo
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本研究在最为薄弱的爬行动物免疫学研究领域进行了有意义的探索。应用抑制性差减杂交技术,首次构建了一个与嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染有关的中华鳖(Trionyx sinensis)主要内脏器官的差减cDNA文库。从200多个克隆中筛选到42个差异或上调表达的基因,其中16个与免疫相关基因系爬行类首次鉴定。经虚拟Northern杂交和RT-PCR验证,其中的6个基因(IL-8、SAA、CD9、ATF4、CL和毒素样蛋白)在中华鳖感染组织均上调表达。   通过RACE方法得到中华鳖IL-8、SAA、毒素样蛋白、CD9和Fg基因的全长cDNA序列并进行了分子结构和进化分析;通过Genome Walking方法得到前3个基因的基因组及启动子序列。中华鳖IL-8基因组全长4924 bp,由三个内含子和四个外显子组成;cDNA全长为1188 bp,开放阅读框包含312 bp,编码蛋白为104个氨基酸,含有保守的CXC结构域、4个半胱氨酸和与功能相关的ELR基序。SAA基因组全长3153 bp,由两个内含子和三个外显子组成;cDNA全长为554 bp,开放阅读框包含381 bp,编码蛋白为127个氨基酸,C-端氨基酸十分保守,N-端由疏水氨基酸组成。毒素样蛋白基因组全长1995 bp,由两个内含子和三个外显子组成;cDNA全长为580 bp,开放阅读框包含267bp,编码蛋白为89个氨基酸,含有8个保守的半胱氨酸和三指蛋白家族的标志序列C-末端CCXXXCN基序。CD9 cDNA全长为1146 bp,开放阅读框包含672bp,编码蛋白为224个氨基酸,包含四个跨膜结构域(TM)和大小两个胞外环(LEL和SEL),LEL内含有保守的CCG基序和4个半胱氨酸,SEL内含一个N-端糖基化位点。Fg cDNA全长为1605 bp,开放阅读框包含1320bp,编码蛋白为440个氨基酸,含有FReD结构域、N-末端球形结构域C-gamma、Ca2+结合位点和聚合口袋结构等。系统进化分析显示,除毒素样蛋白与一种美洲大毒蛇的毒素样蛋白聚为一支外,其余四个蛋白均与鸟类的同源分子聚为一支。   RT-PCR分析显示在中华鳖相关组织中均检测到IL-8、CD9和毒素样蛋白基因的转录产物。其中IL-8基因为组成型表达;CD9基因主要在肝和脾组织表达;而毒素样蛋白基因主要在肝和肾组织中表达。RT-PCR结果表明,除SAA外,其余4种急性期蛋白(APP)Fg、C3、ALB和CL基因均在肝组织表达。   通过RQ-PCR,发现在嗜水气单胞菌感染条件下,IL-8、CD9和毒素样蛋白在中华鳖相关组织中呈现动态表达变化。其中IL-8基因于感染后第4天以肝、脾和肾组织上调表达最明显;而CD9基因在2-4天以肝、脾和血液上调表达最明显;毒素样蛋白基因于感染后第1-2天以肝、脾、心脏和血液上调表达最明显;除ALB基因下调表达外,其它4种APP基因在肝组织均有不同程度的诱导表达,其中SAA于感染后第2天在肝组织上调至2000倍;表明这些基因的表达变化与爬行类抗细菌免疫密切相关。   完成了中华鳖IL-8基因的原核表达和蛋白纯化。趋化实验表明,rIL-8蛋白浓度为1.0-20ng/ml时对中华鳖嗜中性粒细胞有趋化作用,对淋巴细胞趋化作用不明显。首次证实了爬行动物rIL-8对嗜中性粒细胞的趋化作用。
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