机构设置是行政组织的核心，是决定行政效率的关键。中国政府对此有着深刻的认识，自改革开放以来中国政府已经进行了六次重要的机构改革，每次改革都取得了一定的进展，但是仍然很难摆脱“膨胀-精简-再膨胀-再精简”的怪圈。为此，中国政府的机构改革工作不能仅限于停留在“转变政府职能是机构改革的关键”、“机构改革要适应建设社会主义市场经济体制”这些改革口号中，有必要对机构设置工作进行深入的、系统的研究，将更新机构设置工作中的管理理念和管理技术等事宜提上议事日程。　　 中国海关是国家进出关境的监督管理机关，依照《中华人民共和国海关法》和有关法律法规，肩负着监管、征税、缉私、统计四大传统职能。其事权属中央事权，海关总署作为国务院的直属机构，统一管理全国海关，不受行政辖区制约，与其他部门的边界清晰、独立性好。并且，自改革开放以来，海关职能一直比较稳定，在实践中建立起了三级事权管理体制，形成了较为良好的组织框架。这些天然优势使得中国海关率先学习、借鉴发达国家的先进管理理念和管理技术进行机构改革成为可能，使海关适宜作为今后机构改革的一个切入点和突破口。　　 美国在管理学以及管理学应用方面长期处于领先地位。1994年，美国海关进行了一次经典的机构改革。在这次改革中，美国海关以“人员、程序、合作”为主题，与内部员工以及商贸界等外部人员共同研究探讨，对美国海关的六个核心业务流程和六个业务保障流程进行了流程重组，使美国海关机构设置趋于扁平化，强化了部门之间的协同作业，亦对人力资源作了整合优化，至今美国海关仍享受着该次改革的成果。即使因“9·11”恐怖袭击，美国海关等22个联邦政府部门并入国土安全部，亦未对海关内部的组织机构产生过大的影响。　　 本文首先阐明对中国海关和美国海关的机构设置作比较的原因，其中着重说明选择美国海关机构设置作为参照系的主要原因，较为详尽地介绍1994年美国海关机构改革的背景、主题、框架以及成效，旨在说明此次改革在世界各国海关改革中的典范意义。然后，从中国海关和美国海关的机构设置历史沿革及机构设置现状入手，通过历史研究法，了解两国海关的机构发展变化的演进过程，更深层次地寻求中美海关进行机构设置比较研究的基础。有鉴于机构管理工作是一项复杂的系统工程，最后章节则从机构设置工作整个链条的各环节，对中美海关的职能定位、管理理念、管理技术、配套制度等各方面进行了较为完整、务实的比较，从而得出对中国海关机构设置的相关启示。