微滴式数字PCR技术检测肺癌血浆游离DNA中的EGFR及KRAS基因的方法建立

来源 :华南理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:KingGameKingT
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肺癌是我国发病率和死亡率第一的癌症。研究发现,表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)在亚洲肺癌患者的突变率为40%,KRAS的突变率为10%。然而进行组织切片来持续监测疾病的进展极具挑战性,因此需要开发出一种微创或无创的检测方法。液体活检是一个很好的诊断方法,可用于非侵入性的监测疾病进展,血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)主要是存在于血液、滑膜液等体液中,cfDNA的分析是临床医师选择靶向治疗的一个基本工具,且正在成为一个判断预后的强大的监测方法。为了通过捕获和分析血浆游离DNA评估癌症疾病的变化,许多高度敏感和特异的技术已经开发出来。微滴式数字PCR(Droplet digital PCR,DDPCR)是定量检测的一个敏感的方法,只需极少量的样本即可检测,该方法不必参照标准品或内源性对照,高灵敏度和所需样本量少,大大满足了临床珍贵样本如穿刺样本、胸腹水、外周血中靶标序列的微量检测的需求。目的:在此背景下,本研究旨在开发基于数字PCR平台的血浆游离DNA突变基因检测技术,用于肺癌微创检测。通过采集病人血浆样本,检测某些与癌症密切相关的基因EGFR、KRAS突变情况。方法:本研究通过微滴式数字PCR技术,针对肺癌EGFR(E18/19/20/21四个外显子)及KRAS基因共五个位点的37个突变进行特殊的引物和探针设计,以细胞系DNA和阳性标准品为样本进行测试和优化,从而确定反应体系,最终建立对游离DNA中EGFR18/19/20/21及KRAS突变位点的检测方法,最后对351例临床样本进行验证,并比较其与二代测序的一致性。结果:1、以细胞系DNA和阳性标准品为样本进行引物和探针的测试和优化,成功确立了DDPCR法检测血浆DNA中EGFR及KRAS突变位点的反应体系;2、依据文中建立的体系对已合成的阳性质控品进行检测,证明最低检测限可以达到0.04%,通过对商业标准品的检测判断其检测的准确性可以达到100%;3、将二代测序作为金标准,依据已建立的反应体系,通过微滴式数字PCR检测351例肺癌病人cfDNA样本,结果显示E18E19E20E21及KRAS灵敏度分别可以达到100%,96%,97%,100%,93%;与二代测序的一致性可以达到96%以上;结论:本文建立了对游离DNA中EGFR及KRAS突变位点的检测方法,成功开发了一个基于数字PCR平台的血浆游离DNA突变基因检测技术,并证明微滴式数字PCR检测血浆游离DNA的具有很高的特异性和灵敏性。此法提供了一个无创、快捷且绝对定量的动态监测肺癌患者EGFR及KRAS基因突变的方法。该技术不仅可以监测EGFR及KRAS敏感突变的突变率变化,还可以及时检测耐药突变的出现,对肺癌的治疗和预后具有重要的指导意义。
其他文献
无论是技术的革新还是内容的创新,新媒体传播总带给我们新体验。近日,成为热议话题的“夸夸群”的走红,让我们再一次体验了互联网时代“一切皆有可能”的真正含义。夸奖,这一人类
报纸
本文以原则性多义模式为理论依据,并且基于原型场景和多义网络比较分析了介词on与介词at和in的易混淆义项。
目的:观察海藻酸钙微球或海藻酸钙-聚赖氨酸-海藻酸钙微囊包裹对不同特性细胞生长的影响。方法:实验于2004-04/2005-04在解放军总医院老年医学研究所细胞生物学研究室完成。
当今时期,会计准则的国际同一化已成为一个重要的发展势头。中国现在的会计准则已经完成了与国际会计准则的高度趋同。然而美国的财务会计准则则相对自成一个体系,尽管这几年
将前期筛选的优良促生菌菌株(固氮菌N1、NC、N6,解钾菌9K、14K、40K,解磷菌P1)接种到桉树幼苗上,运用随机区组试验设计进行造林试验。1 a后,通过对其林下根际土壤微生物和土
指出翻译作为现代传播的一种方式,具有信息传播"动态""共享""交流"的共性,并借用传播学中受众研究的相关理论对翻译受体的特征和类型进行分析,强调完整的翻译过程应该考虑到
本文主要探讨独立学院非英语专业大学生英语学习倦怠情况及其原因。通过对浙江省某高校独立学院137名非英语专业学生的调查发现:1)独立学院非英语专业学生存在中度的英语学习
<正>十九大报告指出,"我国经济已由高速增长阶段转向高质量发展阶段,正处在转变发展方式、优化经济结构、转换增长动力的攻关期",要"在中高端消费、创新引领、绿色低碳、共享
新事业单位会计制度在固定资产标准、分类、科目设置以及核算等方面做出了较大调整。在这样的背景下分析了新制度下事业单位固定资产核算的主要变化及意义,提出了加强和完善
目的分析乙肝相关性慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)患者治疗前后降钙素原(PCT)水平的差值(ΔPCT)与病情转归的相关性。方法观察组为90例HBV-ACLF患者,空白对照组为30例乙肝肝硬化