【摘 要】
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燕麦是我国重要的粮食作物,也是内蒙古地区的优势作物,燕麦中含有丰富的β-葡聚糖,营养价值很高。全基因组重测序技术可以得到大量的SNP位点进行分子遗传标记,为作物遗传育种及品种选育提供重要参考。本研究对130份燕麦种质籽粒β-葡聚糖含量进行了差异性评价,并选择β-葡聚糖含量极端差异的坝莜18号和迪燕5号进行全基因组重测序分析,获得β-葡聚糖含量相关的SNP位点,并进行了荧光定量PCR验证,明确燕麦籽
【基金项目】
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内蒙古自治区应用技术研究与开发资金项目（2020GG0037）；
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燕麦是我国重要的粮食作物,也是内蒙古地区的优势作物,燕麦中含有丰富的β-葡聚糖,营养价值很高。全基因组重测序技术可以得到大量的SNP位点进行分子遗传标记,为作物遗传育种及品种选育提供重要参考。本研究对130份燕麦种质籽粒β-葡聚糖含量进行了差异性评价,并选择β-葡聚糖含量极端差异的坝莜18号和迪燕5号进行全基因组重测序分析,获得β-葡聚糖含量相关的SNP位点,并进行了荧光定量PCR验证,明确燕麦籽粒β-葡聚糖含量相关的SNP位点,为燕麦β-葡聚糖的分子标记开发及种质资源鉴定提供基础。主要研究结果如下:1、基于β-葡聚糖含量的聚类分析供试种质被划分为3类,第1类有76份燕麦种质,β-葡聚糖含量中等,平均为3.90%;第2类有5份燕麦种质,β-葡聚糖含量最高,平均为5.11%;第3类包括49份燕麦种质,β-葡聚糖含量最低,平均为2.62%。2、高通量测序结果迪燕5号的原始数据为49.5G,坝莜18号为50.7G,过滤后迪燕5号有效数据为49.0G,坝莜18号为50.1G。3、全基因组重测序数据与燕麦参考基因组数据比对,检测出迪燕5号有4146177个SNP位点,坝莜18号有6176966个SNP位点。对迪燕5号和坝莜18号基因功能注释筛选到25个SNP位点,分别落在8个基因上:Pepsico1＿Contig37478、Pepsico1＿Contig39237、Pepsico1＿Contig37825、Pepsico1＿Contig15205、Pepsico2＿Contig10922、Pepsico2＿Contig18947、Pepsico2＿Contig13535、Pepsico2＿Contig16295。8个基因均与控制β-葡聚糖合成途径相关基因家族Cs L有极高的同源性。4、荧光定量PCR结果表明8个基因均在籽粒灌浆期表达,β-葡聚糖相关的SNP位点真实存在。
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