【摘 要】
:
在分子水平上,一个基因(蛋白质)的改变会导致跟它有潜在相互作用的基因(蛋白质)发生改变,这一现象即为共进化(co-evolution)。共进化现象可体现在多个层面,如在单一基因的内
论文部分内容阅读
在分子水平上,一个基因(蛋白质)的改变会导致跟它有潜在相互作用的基因(蛋白质)发生改变,这一现象即为共进化(co-evolution)。共进化现象可体现在多个层面,如在单一基因的内部位点之间(分子内的共进化),在不同的基因之间(分子间的共进化),甚至在基因或蛋白质不同局部结构元件之间。现有的共进化研究主要集中在位点层面,以及基因或蛋白质层面,对于位于二者之间的层面,如蛋白质二级结构元件之间的共进化研究,还比较少。随着系统生物学的发展,在组学水平上研究蛋白质二级结构元件的共进化,对于探索蛋白质之间的共进化和相互作用关系,具有重要意义。本文采用两种蛋白质共进化分析模型,以668个细菌的直系同源家族的蛋白质多序列为基础,首次系统地探索了细菌中的三种蛋白质二级结构类型(α-螺旋、p-折叠、无规则卷曲)之间多种残基物理化学性质的共进化程度。从而推断带电性、疏水性、极性等物理化学性质对细菌中的蛋白质二级结构元件相互作用的影响。通过本文的分析,得到以下具有显著统计学意义的结论:1)对细菌水平的蛋白质二级结构元件的组合类型进行分析,共进化模型计算得到的共进化分值都高于随机模型得到的分值,随机模型得到的共进化分值基本接近于0。这说明细菌中的蛋白质二级结构元件各理化性质的共进化信号并不是随机产生的。2)在细菌蛋白质二级结构元件水平上,不同的残基物理化学性质表现出不同的共进化强度,且具有相互作用的二级结构元件的各理化性质的共进化信号,比没有相互作用元件的理化性质的共进化信号要强很多。这说明在细菌水平的共进化过程中,具有相互作用的蛋白质二级结构元件,有可能由于存在相互作用约束力而产生共进化的现象。细菌在结构上的共进化反映了功能对结构进化的约束。3)在细菌中,具有相互作用的两个蛋白质二级结构元件的体积和带电性的共进化信号,比其它理化性质更明显,其中带电性表现出显著负相关的协同变化特征。
其他文献
清代画家袁江在山水画创作中继承吸收了传统的绘画形式,尤其是宋代,在他的画作中不难看出有宋代画作的遗风,同时又借鉴学习同时代画家的优势,创造出属于自己的独特风格。袁江
随着煤炭、石油等非可再生能源的过度开采,世界能源需求不断增长,环境问题的日益突出,新能源技术应用越来越受到各国的重视。而不同形式的新能源并入电网、不可避免的导致配电网结构越来越复杂,能源网络数据传输场景越来越多。传统电力系统的结构和运行模式发生了改变,能源互联网技术应运而生。如何实现电能传输效率和质量的提高,构建完善的能源网络通信网络。对促进能源互联网的发展,逐步使传统电网向能源互联网演化,具有重
实验目的:细胞骨架在维持细胞形态、运输细胞内物质、传递胞内外信号等方面有着非常重要的作用。细胞皮层处的微丝骨架重排,为细胞内吞提供动力来源;而微管在细胞内部呈放射状
本研究以乌蒙凤鸡为试验对象,制定并实施了保种选育方案,并对零世代各家系生长性能、繁殖性能和一世代育雏期的生长性能进行了测定;二是以醌型二氢生物喋呤还原酶(QDPR)基因和血浆视黄醇结合蛋白4A(RBP4A)基因作为候选基因,利用直接测序技术,分析乌蒙凤鸡QDPR和RBP4A基因单核苷酸多态性,寻找与乌蒙凤鸡生长和繁殖性状相关联的遗传标记;三是采用荧光定量PCR技术对QDPR和RBP4A基因在乌蒙凤
高速铁路的快速发展极大推动了我国经济增长,方便了人们的出行和货物运输,与此同时,对钢轨的质量要求也更加严格。当前,我国各焊接钢轨基地对钢轨廓形检测还主要依靠人工检测,不仅需要更多的劳动力,而且测量精度低、耗时长、数据不便保存,严重阻碍了高速铁路的快速发展。随着激光检测技术的发展,非接触式廓形检测已成为焊前钢轨廓形检测技术的重要手段。因此,本文采用高精度激光轮廓仪,研发一种高精度、高效率、高自动化程
小型化即一个世系中的物种躯体极度变小的一种现象,在脊椎动物中广泛存在。小型化物种存在解剖学结构的简化、行为模式的改变,还可能演化出新特征。其中标准体长小于20毫米的
随着汽车行业的进步,消费者对于其安全性能提出了日益增高的要求,也提升了对其操作稳定性、安全性的需求。电动助力转向系统就是主要将电池作为能量来源,电机为动力,设计好机械结构,以转向盘的转矩和转速作为识别的主要参数,以此作为输入信号,结合控制系统的介入,协助辅助机械转向,最终就可以得到良好的转向特性,电动助力转向系统设计的优劣将直接影响到人们操控方向的准确性和稳定性,这对于保证道路交通安全、减少事故以
传统聚落是人类与自然共同合作的结晶,也是传统文化的重要载体。辽西北地区处在世界主要游牧文化带及农牧交错带上,基于自然及人文因素形成了与其他游牧文化区有所区别的聚落景观。本文以辽西北游牧文化影响下的传统聚落作为主要的研究对象,在实地调研及文献搜集之后,运用文献分析及归纳提炼的方法,针对亟待解决的问题,对辽西北地区游牧文化影响的传统聚落景观进行剖析,并为对受地域文化影响的传统聚落保护与发展提供新的研究
二十世纪艺术领域风起云涌,在这一时期抽象艺术取代了长久以来占统治地位的传统再现性艺术。现代抽象艺术作为一种新的艺术潮流开始蓬勃发展,受到愈来愈多的关注。这股新艺术
VQ模序蛋白是植物中一类高度保守的蛋白质家族,能与WRKY转录因子相互作用,在植物的生长、种子的发育和逆境胁迫应答中具有重要作用。AtARVQ1是拟南芥中34个VQ模序蛋白基因家