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目的了解近年来福建省其它肠道病毒（非EV71及非CVA16的肠道病毒）手足口病的病原构成及分子流行病学特征，包括其它肠道病毒在时间、空间、人群等方面的型别分布特征，以及各种型别肠道病毒的遗传进化特征等。方法1.对福建省2011-2013年1340例其它肠道病毒手足口病病例的标本进行肠道病毒培养分离。用RT-PCR方法对病毒分离株进行扩增，后测序鉴定分型；2.对确定型别的病毒分离株用RT-PCR方法扩增其全长VP1区基因片段并测序，从而获得完整VP1区基因序列。结果1.分型鉴定出375例其它肠道病毒病例，涉及到21种非EV71及非CVA16肠道病毒，CVA6及CVA10为优势毒株，分别占48.5%、25.6%，其次是CVA4，占8.3%。2011年CVA10的构成比最高，为41.6%，其次是CVA6，为29.9%。2012年CVA6的构成比最高，为50.2%，其次是CVA10和CVA4，分别为18.5%和15.1%。2013年CVA6的构成比最高，为60.2%，其次是CVA10为28.0%；2.其它肠道病毒在不同地市、不同性别、不同年龄组、不同病例类型等方面或水平上的优势型别分布均以CVA6和CVA10为优势病毒，除了宁德地区，CVA4、CVA6和CVA10三者构成比相当，其中CVA4略高。CVA6与CVA16相似，其感染致重症率相对较低，而CVA10与EV71相似，其感染致重症率相对较高；3.各个型别肠道病毒的福建分离株与其相应原型株的VP1区核苷酸序列差异在16.3%-28.3%，除了CVA21较低，为12.3%；4.每个型别肠道病毒的福建分离株在进化树上与其相应原型株遗传距离较远，亲缘关系远，CVA6、CVA10、CVA4等多数型别肠道病毒的福建分离株与国外地区分离株的遗传距离较远，亲缘关系远，与国内地区（如山东、深圳等）相应分离株的遗传距离近，亲缘关系近；5. CVA6、CVA10、CVA4等多数型别肠道病毒的福建分离株在进化树上的分布呈多个分支；结论1.福建省手足口病病原谱在2008-2010年期间变化不明显，从2011年开始发生较大变化，EV71及CVA16的比重下降，CVA6、CVA10、CVA4及CVA5等在病原谱的比重增加，2013年的变化更为突出，CVA6、CVA10、EV71及CVA16成为引起手足口病的优势肠道病毒型别；其它肠道病毒的优势型别分布特征没有明显特异性，以CVA6和CVA10为优势病毒；2.各个型别肠道病毒的福建分离株与其相应原型株的VP1区核苷酸序列差异均较大，CVA6、CVA10、CVA4等多数型别肠道病毒的福建分离株在进化树上与国内地区（如深圳、山东等）相应分离株共进化共循环，多数型别肠道病毒在福建至各个地区均存在多条亲缘关系接近传播链同时流行；3.福建省手足口病的病原型别众多，不同型别在不同时期共同循环和相互交替，应加强长期动态地监测和分析。