大黄鱼学名Larimichthys crocea，作为20世纪80年代以前我国最重要的近海水产，由于过度捕捞一度濒临灭绝。从1985年以来，我国开始开展大黄鱼人工养殖研究，并在20世纪90年代末期形成产业规模。　　通过保护繁殖区和人工养殖使得大黄鱼资源得以延续，但由于人工育苗亲鱼来源的单一性，养殖大黄鱼种质退化明显，苗种产量也不稳定。　　尽管一些针对性的分子生物学水平的研究逐渐开展起来，由于缺乏参考基因组序列，这些研究不得不耗费大量的时间和精力来克隆目的基因片段。研究的范围也不得不局限于少数的(不超过20个)已知基因。还有海量的预计超过20000个基因的序列及其在基因组中位置，还处于未知状态。　　从东海区域采集了一条雌性大黄鱼样品。通过高通量测序技术结合生物信息学方法，设计了一系列插入长短不同的DNA样品库，对大黄鱼进行了全基因组测序。在基于de Bruign图的软件的帮助下，将短序列组装成N50达到2.2 kb的contigs，再通过成对信息，将这些contigs连接成NS0达到1 Mb的scaffolds。形成了一份碱基长度在547 Mb长度(约占估计长度的80％)的基因组草图。　　利用ensembl pipeline框架的帮助，对基因组上各种特征序列进行标记。并通过与参考基因组斑马鱼和三刺鱼的全基因组比对，进行了基因预测分析。最终在大黄鱼上找到18199个蛋白编码基因。这些序列标记和基因预测分析，共同组成了大黄鱼基因草图注释。　　这份大黄鱼基因组草图注释，很好地改善了大黄鱼分子生物学研究的现状，为进一步研究其育种、营养、保护提供了重要的参考。