钌(Ⅱ)多吡啶配合物与RNA三螺旋结合作用的研究

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在分子生物学领域中,发现RNA三螺旋poly(U)(9)poly(A)·poly(U)在很多生物功能活动中起着重要的作用。但是RNA三螺旋Hoogsteen氢键的弱稳定性,会导致整个RNA三螺旋结构的不稳定,从而限制在生物功能活动中的应用。根据目前的研究结果表明钌(II)金属配合物作为结合剂与RNA三螺旋结合,对调节三螺旋的稳定性具有大的发展潜力。因此,本文设计了一些新型钌(II)多吡啶配合物,作为结合剂来调节RNA三螺旋的稳定性。首先,设计合成了手性钌(II)多吡啶配合物Δ-[Ru(bpy)2(6-NO2-dppz)]2+(Δ-1)和Λ-[Ru(bpy)2(6-NO2-dppz)]2+(Λ-1)。研究结果表明,Δ-1和Λ-1与RNA三螺旋为插入结合,Δ-1的结合亲和力略大于Λ-1。两种对映体对RNA三螺旋的稳定作用没有明显的选择性。其次,设计合成了主配体结构不同的配合物[Ru(bpy)2(5-idip)]2+(Ru-2)和[Ru(bpy)2(biip)]2+(Ru-3),Ru-2和Ru-3的主配体尾端分别是吲哚和苯并咪唑。分析测试结果可知,Ru-2,Ru-3与RNA三螺旋结合是插入结合,Ru-3的结合亲和力和对三螺旋的稳定性远大于Ru-2。Ru-3对RNA三螺旋没有明显的选择稳定性,而Ru-2对第三链具有选择稳定性,并且只有一个突变点。因为前面所研究的Ru-2对RNA三螺旋的第三链有选择稳定性,于是合成了与Ru-2结构一样的手性配合物Δ-2和Λ-2。两种对映体与RNA三螺旋的结合都为插入结合,Δ-2与RNA三螺旋的结合强度略大于Λ-2。同时,两者能够稳定RNA三螺旋的第三链和模板双链,但更倾向于稳定第三链,没有明显区别,但是不同于Ru-2。Ru-3对RNA三螺旋结构具有良好的稳定作用,于是研究了具有不同手性的Ru-3与RNA三螺旋的结合特性。结果表明两个对映体与RNA三螺旋都为插入结合,Δ-3与RNA三螺旋的结合强度略大于Λ-3。同时,两种对映体都能较好的稳定RNA三螺旋的第三链和模板双链,更倾向于稳定第三链,Λ-3的稳定效果好于Δ-3,但不同于Ru-3,表明配合物与RNA三螺旋结合体系是复杂的。最后,设计了辅助配体不同的钌(II)多吡啶配合物[Ru(bpy)2(iip)]2+(Ru-4),[Ru(phen)2(iip)]2+(Ru-5)。分析测试结果得到,Ru-4和Ru-5与RNA三螺旋的结合为插入结合,Ru-5的结合亲和力略大于Ru-4。两种配合物都能较好的稳定RNA三螺旋,Ru-4能有效提高第三链和模板双链的稳定性,更倾向于稳定第三链,而Ru-5是选择性稳定第三链,对模板双螺旋没有影响。
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