华山新麦草(Psathyrostachys huashanica)是禾本科(Poaceae)大麦族新麦草属(Psathyrostachys)多年生草本植物，是国家Ⅰ类珍稀濒危植物和急需保护的农作物野生亲缘物种。具有抗寒、抗旱、早熟、优质、抗多种病害等优良特性。小麦低分子量谷蛋白亚基(LMW-GS)对小麦品质具有重要影响，可以形成与面筋强度有关的聚合体。为了挖掘和利用华山新麦草的优良基因，扩大小麦品质种质资源，为小麦转基因提供可靠的基因资源，本文根据已经发表的小麦属LMW-GS基因序列，设计引物，采用聚合酶链式反应技术(PCR)对华山新麦草低分子量谷蛋白亚基(LMW-GS)基因进行了基因克隆和序列分析，将获得的基因序列命名为HS--LMW-1。其结果如下： 1.HS-LMW-1基因与小麦的近缘种属的物种LMW-GS基因具有较高一致性，并且根据HS-LMW-1基因序列而推测的多肽序列与普通小麦、钩刺山羊草、中间偃麦草的LMW-GS也具有较高的一致性，并且该多肽序列结构与Cassidy et al．(1998)建立的LMW-GS多肽结构模型一致，所以HS-LMW-1基因就是华山新麦草LMW-GS基因。华山新麦草LMW-GS长为866bp。 2.LMW-GS基因序列在编码区的不仅在小麦属具有保守性，而且在小麦属和华山新麦草间也具有的保守性。 3.华山新麦草LMW-GS基因是位于Ns3位点。 4.根据通用三联体密码推导的氨基酸序列显示，该序列具有单一完整的开放阅读框(ORF)，其中在3’有长24个碱基的非翻译区，在5’端有17个碱基的非翻译区，可编码274个氨基酸残基的成熟蛋白。华山新麦草低分量谷蛋白多肽结构包括由22个氨基酸残基组成的信号肽(signal peptide)，13个氨基酸残基组成的N-末端保守区(N-terminal do-main)，N-末端区之后是由重复短肽组成的重复区(repetitive domain)，116个氨基酸残基组成，该区富含谷氨酰胺(Q)和脯氨酸(P)，含有14个重复单元、13种短肽，其中PPFSQQQQ是重复次数最多的短肽。最后是保守的C-末端区(C-terminal domain)，由123个氨基酸残基组成，该区域共有5个半胱氨酸残基。华山新麦草LMW-GS多肽结构与Cassidy et al．(1998)建立的LMW-GS多肽结构模型一致。华山新麦草低分子量谷蛋白亚基属于LMW-m型，而华山新麦草低分子量谷蛋白N-末端氨基酸序列为METGRIPSL，与普通小麦METSRIPGL-类型相比G，S位置互换。 5.多肽序列第36-67位，80-103位，110-147位的区域为多肽内部不规则区；166-267位的区域为Tryp.alpha.amyl区。6-21，7-20，217-227，218-225片段为跨膜区。蛋白的二级结构主要α螺旋，延伸链，无规则卷曲组成。该蛋白预测存在于细胞外，可能为分泌蛋白。华山新麦草LMW-GS基因序列的获得，对开发和保护华山新麦草这一濒危物种，挖掘和利用华山新麦草的优良基因，丰富小麦属品质相关基因种质资源，扩大小麦转基因的基因来源，具有比较重要的理论和实践意义。