植物细胞质雄性不育恢复基因遗传作图的统计方法

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新恢复基因的发掘及恢复基因的定位对利用杂种优势提高农作物的产量、更好的理解细胞质雄性不育恢复的机理具有重要的理论和实践意义。由于恢复基因的作用方式常常是多样化的,即使在一个物种中,育性恢复也可能是通过不同的恢复基因来调控,以及通过不同的途径来进行。本文建立了两种遗传模型,对细胞质雄性不育恢复基因的遗传作图方法进行了研究。提出了模型参数估计的最大似然法,利用与恢复基因连锁的分子标记的分离信息,分析在F2单位点和F2两位点模型下孢子体不育、配子体不育以及相引相和相斥相的情况下不同样本容量和不同重组值对估计效果的影响。得出的结果如下:1.根据不同类型的分子标记构建了两种遗传模型,分别为F2单位点模型和F2两位点模型。利用极大似然法推导出完全标记信息下重组率的计算公式。在已知恢复基因与确定的分子标记连锁的情况下,可以选择F2单位点模型,而在不明确恢复基因与哪个分子标记连锁的情况下,就选择F2两位点模型。2.用模拟方法估计参数的偏差值(Bias)、标准误差值(se)和均方差值(MSE),并利用其判断不同的群体样本容量和不同的重组值对参数估计效果的影响。结果显示:在F2单位点和F2两位点这两种情况下,不同样本容量对参数估计效果有明显的影响,孢子体不育和配子体不育的共显性、显性-相引和显性-相斥模型都是样本容量大的条件下估计效果最好。在F2单位点情况下样本容量大于270时的估计效果最好,在F2两位点情况下样本容量大于570时的估计效果最好。在F2单位点和F2两位点模型中不同重组值对参数估计效果也有明显的影响,孢子体不育和配子体不育的共显性、显性-相引和显性-相斥模型都是在重组值小的条件下估计效果最好;在F2单位点和F2两位点模型中孢子体不育和配子体不育情况下共显性的估计效果最好,显性-相引模型的估计效果次之,显性-相斥模型的估计效果最差;F2两位点模型比F2单位点模型的估计效果更好。
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