本文运用BPR理论研究天津口岸的集装箱检验检验管理。集装箱检验检疫业务是集装箱通关环节中重要的一环。快速发展的集装箱运输业使目前的集装箱检验检疫管理模式难以有效解决提高集装箱检验检疫速度和严格监管的矛盾。提高集装箱检验检疫效率、促进企业有效出口和保证国境检验检疫安全已经变得十分必要与迫切。本文以BPR理论为主线，首先，论述了目前天津口岸的集装箱检验检疫管理和业务流程现状。其次，分析了其中存在的问题，主要问题有：检验检疫组织机构设置以职能为中心；与其它有关部门未建立必要的信息交换系统；业务流程存在障碍；集装箱检疫查验抽检比例缺乏动态变化；集装箱场站分散、缺乏专门检疫区域。然后，根据存在问题提出：重组检验检疫组织机构；重组检验检疫人员；重组集装箱检验检疫业务流程；运用电子口岸与集装箱检验检疫业务信息网络系统、风险分析理论和分类管理理论，提高集装箱检验检疫效能。最后，选择效能评估指标，对比集装箱检验检疫业务流程重组前后。运用BPR理论研究集装箱检验检验业务管理，得出如下结论：业务流程重组后，集装箱检验检疫效能显著提高。