【摘 要】
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卵巢癌（OC）是目前最普遍的恶性妇科肿瘤之一,是影响女性人群中与恶性肿瘤相关患者死亡率的第五大因素。虽然卵巢癌在妇科恶性肿瘤中居于第三位,但其病人死亡比例却是最大的。最近的研究发现,免疫细胞在抑制肿瘤的发生和侵袭中也发挥重要作用,并且免疫疗法也具有高效、毒害低等特点。因此我们试图通过挖掘与卵巢癌患者预后相关的免疫基因,并建立OC的预后特征,以改善卵巢癌的预后以及治疗。在该研究中,我们在TCGA数据
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卵巢癌（OC）是目前最普遍的恶性妇科肿瘤之一,是影响女性人群中与恶性肿瘤相关患者死亡率的第五大因素。虽然卵巢癌在妇科恶性肿瘤中居于第三位,但其病人死亡比例却是最大的。最近的研究发现,免疫细胞在抑制肿瘤的发生和侵袭中也发挥重要作用,并且免疫疗法也具有高效、毒害低等特点。因此我们试图通过挖掘与卵巢癌患者预后相关的免疫基因,并建立OC的预后特征,以改善卵巢癌的预后以及治疗。在该研究中,我们在TCGA数据库中的下载了379个卵巢癌样本,在GTEx数据库中下载了88个正常卵巢组织样本。随后我们对两个组进行了差异表达分析,根据预先设定好的阈值,我们一共选取了2857个差异基因（p＜0.05）。为了进一步获取与卵巢癌紧密相关的基因,我们进行了加权基因共表达网络分析,发现浅蓝色模块是与卵巢癌的相关性最高（R=0.98,p＜0.01）,表明该模块里的基因在卵巢癌中发挥重要作用。随后我们提取了浅蓝色模块中的1915个基因与免疫相关基因的交集基因,共得到了156个与卵巢癌密切相关的免疫基因。接下来,我们再对156个免疫基因进行了蛋白互作分析,并将其中29个基因作为关键基因。通过对29个基因进行Cox回归分析,我们确定CXCR4、CX3CR1、CXCL9、CXCL10和CXCL11这5个基因是与卵巢癌预后相关的基因,并使用这些基因构建了卵巢癌预后风险评分模型。为了探究模型的可靠性,我们在TCGA队列中进行了验证,ROC曲线分析和Kaplan-Meier（KM）生存分析结果表明该预后模型具有较高的预后能力（HR=2.7;95%:2.07-3.7;p＜0.001）,在低风险组的患者的总体生存时间与存活率显着更好;另外我们将ICGC队列作为外部验证,其结果同样也表明该模型具有较高的预后能力（HR=2.4;95%:1.38-4.3;p=0.018）。此外,根据免疫浸润分析结果我们发现在低风险组中有更多的免疫细胞存在,包括T细胞、B细胞以及NK细胞等,提示低风险组的患者可能对免疫治疗更敏感。总的来说,我们通过对TCGA中的卵巢癌样本进行生物信息学分析,鉴定到了5个卵巢癌预后相关的免疫基因,其中4个基因与卵巢癌的预后好相关。基于这5个基因我们构建了卵巢癌免疫特征预后模型,为卵巢癌的诊断及治疗提供新见解。
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