论文部分内容阅读
目的:人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus,HIV）感染后导致的艾滋病（acquired immunodeficiency syndrome,AIDS）是全球的公共卫生问题。迄今为止,抗逆转录病毒治疗（anti-retroviral therapy,ART）仍是控制艾滋病疫情蔓延最有效的方法。赣州市HIV-1虽然起始流行时间晚,但是新发感染者的人数却逐年增加,成为江西省HIV-1流行的重点区域。然而,赣州市ART的HIV/AIDS患者中HIV-1的流行现状和基因型耐药特征却仍不清楚。方法:本课题招募了截至2020年8月31日,赣州市接受ART的HIV/AIDS患者,从病毒学失败患者的血浆样本中扩增HIV pol基因的全长序列。使用最大似然法构建系统发生树,应用Bootscan分析序列的的重组结构,确定序列的亚型。根据斯坦福大学HIV耐药数据库分析序列的耐药突变位点和对抗逆转录病毒药物的敏感性,使用Cluster Picker分析序列之间的传播关系,阐述赣州市ART失败患者HIV-1基因型耐药的特征及耐药株的流行现状。结果:赣州市2204名接受ART的HIV/AIDS患者中有287名患者病毒载量＞400拷贝/m L,病毒学失败的比例为13.0%。在病毒学失败的患者中,成功扩增了211名患者血浆样本中HIV pol全长基因序列,鉴定出9种HIV-1亚型,分别为CRF08＿BC（37.0%）、CRF01＿AE（26.1%）、CRF07＿BC（25.6%）、CRF55＿01B（5.7%）、B亚型（1.9%）、RF＿01B（1.4%）、RF＿0107（1.4%）、C亚型（0.5%）和RF＿01C（0.5%）。211条序列中有100条含有耐药突变位点,耐药株占比为47.4%。男性和女性患者之间耐药突变序列的百分比无统计学差异（P=0.673）,而在不同年龄、病毒载量和HIV-1亚型方面有显著统计学差异（P＜0.05）。其中,31-40岁、病毒载量为582-10000拷贝/m L和感染CRF55＿01B的患者分别具有最高百分比的耐药突变株。100条耐药株含有379个耐药突变位点,非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTI）和核苷类逆转录酶抑制剂（NRTI）的耐药突变位点分别为206个和169个,整合酶抑制剂的耐药突变位点3个,链转移酶抑制剂的耐药突变位点1个。100条耐药株序列主要对阿巴卡韦、恩曲他滨、拉米夫定、依非韦伦和奈韦拉平产生了耐药。100条耐药株中以CRF08＿BC、CRF01＿AE和CRF07＿BC最为普遍,耐药突变株所占百分比分别为44.9%（35/78）、52.7%（29/55）和35.2%（19/54）。这3种亚型中常见的耐药突变类型是M184V和K103N,而M41L、D67N、K70R、K101E、V106M、Y181C、K219E、H221Y和N348I的突变频率在亚型之间存在明显差异。这3种亚型的ART药物的耐药水平和频率相似,但与CRF01＿AE和CRF07＿BC相比,CRF08＿BC对NNRTI药物的耐药突变位点比例更高,对NRTI药物和NNRTI药物的耐药频率更低。211条序列共形成24个传播簇,其中包含耐药株序列的传播簇有13个,占比54.2%。CRF08＿BC耐药传播簇的比例为41.7%（10/24）,CRF01＿AE耐药传播簇的比例为8.3%（2/24）,CRF07＿BC耐药传播簇的比例为4.2%（1/24）。结论:赣州市有9种HIV-1亚型共同流行,流行亚型复杂多样,其中主要的流行亚型为CRF08＿BC、CRF07＿BC和CRF01＿AE,流行比例相近;ART病毒学失败患者中HIV-1耐药株的流行比例相对较高;不同HIV-1亚型间耐药突变株的比例、耐药突变位点百分比在NRTI和NNRTI上的分布特征、耐药突变位点的类型和频率及对ART药物的耐药水平及频率不一致;HIV-1耐药株已存在扩散传播现象。因此,在HIV/AIDS患者选择ART策略、开发新型抗逆转录病毒药物及制定艾滋病防控措施时应予以考虑。