基于单细胞转录组测序的肝癌免疫微环境功能特征研究

来源 :华东师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:muyi_wang
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肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是高发病率和高死亡率的恶性肿瘤之一,其肿瘤发展与机体的免疫微环境异常密切相关。HCC的现有治疗手段主要是临床手术,并且放射疗法和化学疗法效果受限,通过免疫学机制研究可为HCC治疗提供新的治疗策略。肿瘤的免疫微环境具有高度异质性,不同种类的细胞互相调控肿瘤的发生发展过程。单细胞测序技术克服了传统测序中无法有效识别不同细胞类型及其功能的弊端,基于单细胞水平揭示了准确而细致的细胞状态,有助于全面了解HCC的免疫微环境组成,为HCC个体化免疫治疗提供参考。本文基于临床HCC患者获得的6个肿瘤及癌旁标本进行单细胞转录组测序,通过对24267个细胞执行聚类分析后获得19个细胞亚群,对各亚群细胞进行功能注释。之后,基于定义的19个细胞亚群做深入分析,主要包括表征各细胞亚型的功能特点、描述细胞发育分化路径、探究细胞间相互作用关系、分析亚群内部的基因调控网络以及挖掘生存相关的免疫治疗靶点。基于这五个维度对HCC免疫微环境中各类型细胞进行详细描述,我们对已有报道的细胞亚群的功能状态进行扩展,并发现了既往研究中未报道的新的巨噬细胞亚群(CD3+巨噬细胞),分析该亚型细胞可能通过补体信号通路促进效应T细胞分化并增强效应功能,从而发挥抑癌作用,生存分析进一步验证了患者体内高富集该亚群细胞可显著提高HCC预后。总而言之,本研究提供了一个肝细胞癌免疫微环境的单细胞图谱,揭示了不同细胞类型的功能状态及发展轨迹,并发现了新的免疫细胞类型,提供潜在的免疫治疗靶点,为HCC的免疫治疗提供参考与思路。
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