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在具有相同基因组的金鱼雌核发育单倍体和二倍体胚胎发育过程中,单倍体本身的条件导致了它在基因表达上有缺陷,发育不正常,而二倍体发育正常。本研究采用蛋白质组学的研究手段对金鱼雌核发育单倍体和二倍体胚胎作了一系列的研究,共分为两个部分:第一部分,为了研究金鱼雌核发育单倍体和二倍体胚胎发育过程中的蛋白质表达水平的差异,并阐明单倍体不能正常发育的机制,我们以遗传背景一致的金鱼雌核发育单倍体(HE)和二倍体(DE)早期发育过程的胚胎,即神经板期(为受精后18小时)的胚胎为材料,提取胚胎的全蛋白质,采用双向凝胶电泳进行蛋白质点的分离,获得重复性较好的凝胶图谱,经PDQUEST 2D分析软件对HE和DE的差异蛋白质进行比较分析,HCT质谱初步鉴定了43个差异蛋白质,包括一些分子伴侣、细胞骨架蛋白和酶类,另外还有大量卵黄蛋白质被鉴定到。在金鱼早期发育过程中,卵黄蛋白作为主要的营养物质,为鱼类发育提供必要的能量,因此卵黄蛋白为高丰度蛋白质,而大部分在表达水平上急剧变化的蛋白质,例如某些转录因子和信号蛋白,由于丰度低,在2-DE凝胶上无法清楚的展示。为了降低样品的复杂程度,富集低丰度蛋白质,提高蛋白质的检出灵敏度,鉴定到一些低丰度的转录因子和信号蛋白,我们提取雌核发育单倍体胚胎核蛋白(HEN)和正常二倍体胚胎的核蛋白质(DEN)进行研究,并采用定量蛋白质组方法2D-DIGE对蛋白质点进行分离,再经Decyder分析软件对HEN和DEN的差异蛋白质进行分析,得到97个差异蛋白质点,经HCT质谱分析初步鉴定了66个差异蛋白质。通过对这些差异蛋白质点的功能分析,发现一些与发育调控、神经发育、细胞分化、信号传导等相关的蛋白质。结果表明金鱼雌核发育单倍体和二倍体胚胎在发育过程中基因表达水平上有显著性差异,这些差异也许是导致单倍体发育不正常的原因。第二部分,前期研究表明在金鱼雌核发育单倍体胚胎发育过程中,一些对发育起关键作用的基因未能被选择表达或表达受阻而导致单倍体发育异常。在单倍体胚胎发育过程中出现了正常眼,泡状眼,无腔眼三种表型,经统计分析表明,单倍体发育的胚胎数目以正常眼:泡状眼:无腔眼为1:2:1的比例分配。已有研究证明Vsx1基因在单倍体胚胎中表达受阻,而导致了单倍体胚胎发育异常,其中正常眼单倍体胚胎中Vsx1基因能够表达,无腔眼中Vsx1的基因不能表达,泡状眼中等位基因中一个表达,一个未表达。与二倍体相比,Vsx1基因在单倍体胚胎中未能被选择表达,可能与单倍体胚胎发育异常有关。为了揭示金鱼雌核发育单倍体胚胎发育过程中的这种发育异常的机制,本文以遗传背景一致的金鱼雌核发育单倍体形成的无腔眼(CLHE)和正常眼(NHE)的相应眼睛色素出现期的胚胎为材料,提取胚胎全蛋白质后,采用双向凝胶电泳进行蛋白质点的分离,获得重复性较好的凝胶图谱,再用PDQUEST 2D分析软件对CLHE和NHE的差异蛋白质进行比较分析,经MALDI-TOF/TOF和Q-TOF质谱分析鉴定了59个差异蛋白质点。通过生物信息学分析方法对这些差异蛋白质点的功能分析,发现了与眼睛发育,神经发育,细胞分化,体节形成,信号传导等相关的蛋白质。此外,通过免疫印迹法和免疫组织化学法,某些重要差异蛋白质已得到了进一步的验证。