大豆疫霉根腐病是一种毁灭性的土传病害,由大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)引起,自20世纪90年代在我国东北地区被发现以来,逐渐在全国都有报道发生,成为影响大豆产量的重要病害之一。本研究从中国东北地区和新疆采集到大量大豆根腐病病样,通过建立CAPS和SSR标记对179个大豆疫霉菌株进行遗传多样性分析,研究结果如下:1.从东北地区和新疆采集到了442株大豆病样,其中有205株是被大豆疫霉菌侵染发病。从新鲜感病组织和感病严重的干老组织上分离到137株大豆疫霉菌。改进了分离方法,大豆疫霉菌的分离率达到31%。2.用代表4个大豆疫霉菌基本基因型的模式菌系筛选CAPS和SSR标记,对大豆疫霉菌群体进行遗传多样性分析。3.对179个供试菌株进行的遗传多样性分析表明,有41个菌株和四个基本基因型相同,同时部分菌株产生了不同于四个模式菌系的带型,表明国内的大豆疫霉菌存在不同于四个基本基因型的变异;聚类分析将179个分离物划分为7个聚类组,东北群体在7个聚类组中均有分布,新疆群体分布在4个聚类组中,且东北群体的Shannon’s多样性信息指数高于新疆群体,这表明东北群体的遗传多样性比新疆群体的丰富;东北群体和新疆群体的遗传相似性很高(0.9935)。在基因型多样性分析中,新疆群体所出现的基因型在东北群体中均有分布,而东北群体中有3种基因型是新疆群体所没有的,据此推测新疆的大豆疫霉菌有可能是从东北传入。