多杀性巴氏杆菌全基因组特征及檀香醇对多杀性巴氏杆菌的转录组分析

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多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,Pm)能引起多种动物和人产生巴氏杆菌病。对巴氏杆菌病的防治仍然是一个难题。本研究为探究多杀性巴氏杆菌的致病机制,比较了PmA和PmD在基因组上的差异。同时,在此基础之上利用转录组的方法研究了檀香醇对Pm抑菌的机制,为揭示多杀性巴氏杆菌致病机制和抗生素替代研发奠定基础。1.多杀性巴氏杆菌强弱毒株分裂差异基因分析通过Illumina对PmA、PmD进行全基因组测序。结果表明,PmA和PmD的基因组大小和组成基本相同:PmA为2599048bp,G+C含量为39.932%,编码2580个基因。PmD为227 4155 bp,G+C含量为40.26%,编码2130个基因。PmA和PmD具有相同的代谢途径。PmD、PmA二个基因组的差异体现在基因的拷贝数和种类上。进化分析发现,Pm的进化共分为2支,即PmF单独1支,其它4个血清型为另一支,具有较近的亲缘关系;不同的血清型(包括分子分型)的进化群未见明显的宿主特异性,但具有一定的地域性。2.檀香醇抗多杀性巴氏杆菌机制的转录组分析抑菌实验发现,檀香醇对PmA有很好的抑菌效果。转录组分析结果表明,多杀性巴氏杆菌经檀香醇处理后,共有2864个基因的表达出现变化,其中有43个基因的表达出差异现显著:23个基因为显著上调,20个基因为显著下调。这些基因中,核糖体蛋白基因受影响的有13个,细胞分裂相关基因fts Z、复制体起始基因pri B、转录起始相关基因rpo E、转录终止相关基因nus G显著下调。可见,檀香醇的抑菌作用主要是通过影响基因的复制、翻译和转录多个环节,同时也影响Pm的细胞分裂。综上所述,PmA和PmD在基因组上的差异较小,包括基因的拷贝数和种类。进化上PmF与PmA、B、D、E亲缘关系较远。檀香醇通过影响基因的复制、翻译和转录以及Pm的细胞分裂来进行的。
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