POFUT1在胶质瘤中的表达、作用及预后评估价值的研究

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目的:研究O-岩藻糖基化转移酶(Protein O-fucosyltransferase 1,POFUT1)在胶质瘤中的表达情况及发挥的生物学功能,并初步探索POFUT1对胶质瘤发挥调控作用的分子机制。方法:1.利用CGGA数据库和TCGA数据库分析POFUT1在胶质瘤组织中的表达量情况;利用卡方检验分析POFUT1的表达量和患者临床信息的相关性;利用Kaplan-Meier生存分析和COX回归分析进行POFUT1的表达量与患者生存预后的分析;2.通过免疫组织化学技术检验POFUT1在不同级别胶质瘤中的表达水平,并通过卡方检验、Kaplan-Meier生存分析和COX回归分析等统计学方法研究POFUT1表达水平与各项临床病理参数间的关系;3.利用慢病毒转染技术构建稳定过表达POFUT1的U251细胞系,利用小干扰RNA(Small Interfering Ribonucleic Acid,si RNA)在U251和U87细胞系中敲低POFUT1基因;通过蛋白质免疫印迹法(Western Blot)与实时定量聚合酶链式反应法(Real-time Quantitative Polymerase Chain Reaction,RT-q PCR)分别检测POFUT1的蛋白表达水平和m RNA表达水平;通过MTT法和Transwell法检测POFUT1对胶质瘤细胞增殖及侵袭迁移能力的影响;4.通过裸鼠体内异种移植瘤模型验证POFUT1对胶质瘤体内增殖的影响;5.对POFUT1过表达细胞系和敲低细胞系进行转录组测序,筛选出显著差异表达基因,进行京都基因和基因组的百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集、基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)等分析。结果:1.POFUT1在胶质瘤组织中表达水平显著高于瘤旁正常组织(p<0.05);高表达POFUT1胶质瘤患者预后显著差于低表达患者(p<0.001);2.POFUT1表达情况与患者的年龄、性别、发病状态、临床分期、IDH突变类型等因素具有相关性;在不同年龄段组、不同性别、LGG组、GBM组、IDH突变组、IDH野生组、初发组、复发组、MGMT甲基化组以及MGMT非甲基化组中,高表达POFUT1患者的生存期均显著高于低表达患者(p<0.05);考虑了POFUT1因素的预后模型可以更好的评估患者的预后;3.过表达POFUT1可促进胶质瘤细胞迁移和侵袭,敲低POFUT1可抑制胶质瘤细胞迁移和侵袭(p<0.001);4.过表达POFUT1可促进裸鼠皮下成瘤(p<0.001);5.POFUT1过表达和敲低后转录组测序发现显著差异基因主要富集到JAK/STAT、ECM受体、TGF-β、P53、PI3K/AKT、细胞黏附、细胞周期等通路。结论:POFUT1可以作为胶质瘤患者的预后预测标志物,该基因过表达可促进胶质瘤的增殖和侵袭。
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