我国高等院校在办学方式、建设理念和资源配置等方面正在多元化快速发展,在密切参与社会资源分配的同时,也肩负更多的责任。高校的内部审计的监督作用,相对于高校职能部门以及企业单位的内部审计,尚存在不少欠缺之处。尤其是专业性强、资金量大的基建工程,加大了内部审计工作的难度和复杂程度。本文的案例学校S大学位于我国西北地区,但是由于经济技术的落后,使得该校内部审计机构存在一些缺陷,运行机制尚不完善,希望本文可以为部分地区高校的内部审计建设带来一些新想法。本文使用案例研究法和文献研究法,从基建工程内部审计的概念和理论入手,结合实习经历,发现基建工程内部审计机制、程序、方法等方面存在的不足。通过阅读相关审计实务指南和目前基建工程内部审计相关内容的前沿研究成果,结合该学校管理架构、运行特点等情况和最新前沿审计技术方法,为该校的基建工程内部审计质量控制提出建议。同时建立一个适合于高校基建工程内部审计的质量评价体系,协助高校管理评价内部审计质量,以达到其监督职能并为高校治理的增值做出贡献。以S大学G工程为例,发现了基建工程内部审计存在的一些问题。第一,在工程前、中期阶段的内部审计过程中,未充分落实全过程跟踪审计,没有利用新兴的内部审计信息技术,同时忽视了技术审计的重要性;第二,在工程竣工结算的外包审计过程中,针对外包的第三方审计单位,缺乏足够的管理监督;第三,在完成审计程序后,未发布基于全过程的跟踪审计报告,同时对审计结果的利用不够充分。产生这些问题的原因主要在于内部审计部门制度建设不完善,比如:内部审计人员力量不足、基建工程内部审计工作手册不完整、审计定位模糊造成的审计职责混乱等问题。针对上述S大学基建工程内部审计存在的问题,本文提出了以下几点建议:第一,认真落实工程前、中期阶段的审计工作,并优化审计技术和方法,如统筹规划分项分部审计过程、强调技术审计并建立内部审计信息系统;第二,全面控制外包单位的审计质量,降低审计风险;第三,在审计的最后阶段,形成基于全过程的全过程跟踪审计工作,要加强对审计结果的利用,强调审计结果的公开透明。同时,为了保障上述优化建议的实施,还应当完善内部审计部门制度建设,比如建立基于审计项目质量的考评制度,增强内部审计机构独立性,清晰审计定位并增加专业的工程审计人员。通过以上的优化建议和措施,可以将内部审计业务细分至基建工程审计,力求将审计工作做到高效、精确、真实,可以最大力度地展现内部审计监督评价职能的作用。