近年来,随着我国市场经济改革的不断发展,烟草行业的产品和生产技术也在更新提升,随之而来烟草企业投资的建设项目越来越多,工程审计作为预防投资风险的最佳手段正不断重视。由于烟草行业工程建设项目具有投资金额大、业务复杂、覆盖范围广、建设周期长等特点,工程审计面临专业性需求高、数据量多、管理难度大等的问题。同时,烟草行业不同于一般企业,我国卷烟生产销售属于垄断经营并且有相当严格的法律规定,国家对烟草行业实行统一化的垂直领导管理模式,烟草企业的投资建设项目直接关乎国家利益,国家对烟草行业工程审计也是高度重视,这导致烟草行业工程审计也有其行业一定的特殊性。在信息时代,通过信息技术和互联网的运用,能够包容烟草行业工程审计特性、提高工程审计效率、保证工程审计质量、降低工程审计的风险。本文在完成过程中首先对国内外文献和工程审计信息化相关概念和理论基础进行了深入研究,结合自己的工作实习经历,掌握了烟草行业当前工程审计现状、工程审计的特性以及审计信息化的背景。运用案例分析法研究五年之间大量工程审计项目,选取两个具有行业共性问题的工程建设项目进行案例研究,归纳总结出当前烟草行业存在工程资料管理不完善、共享效率低,审计成果利用率低,审计业务流程不规范、缺乏有效监督的问题。在此基础上,本文从审计信息化的角度出发,以烟草行业工程审计为研究对象,对工程审计信息系统做了全局性的功能分析,提出将系统分为五大功能模块的建议:工程项目管理中心、审计项目管理中心、工程项目信息、工程审计报表、工程基础设置,并对系统的各模块基本框架构建,业务流程设置提出相应建议,有效应对了烟草行业工程审计的诸多问题,满足了工程审计各部门对信息系统的需求。本文对系统功能构建提供的建议对于提高工程审计效率、提升审计质量、降低审计风险等方面有积极意义,扩充了工程审计思路,也为烟草行业工程审计信息化系统开发提供参考借鉴,保证烟草行业工程审计信息化能够顺利实现。