位于河流与海洋的交汇处的河口生态系统，在降雨、地表径流、海洋及人类活动等因素作用下承载着较大压力。携带泥沙及污染物质的入海河流与海水交换混合，污染物的汇集对河口构成了一定程度的危害，河口水生态健康状况受到威胁。因此，开展河口生态系统的健康评价研究，对于深入评价河口生态系统健康状况及提出河口区水生态环境管理措施具有重要现实意义。。目前，河口生态系统健康一直倍受国内外学者和研究机构的关注，但尚未形成完整、统一的评价方法和指标体系。本文依据2009年枯水期、2010年丰水期和平水期的大辽河口区河流段及口外海滨段水质、底质和水生生物的监测数据，采用主成分分析法对监测指标进行筛选，选出了具有代表性、相对独立并能够反映河口生态健康状况的溶解氧、悬浮物、氨氮、总氮、总磷、石油类、浮游动物多样性指数、浮游动物生物量、浮游植物生物量、浮游植物多样性指数、底栖动物生物量、底栖动物多样性指数、重金属（Cu、Pb、Zn和Cr）生态危害指数等16个指标；构建涵盖水环境质量、生物质量和沉积物质量的评价指标体系；通过层次分析计算并结合专家意见确定指标权重。运用集对分析模型对不同时期的大辽河口的生态健康状况进行评价。评价结果表明，在枯水期、丰水期和平水期，大辽河口的健康状况均表现为河流段自入海口至上游逐渐恶化的趋势，口外海滨段域自入海口至远入海口端逐渐好转的趋势；河口河流段的健康状况优于口外海滨段；季节性差异表现为丰水期>平水期>枯水期的趋势。鉴于河口生态环境的复杂性和难确定性，本文将集对理论引入生态健康评价体系，对大辽河口生态系统的健康水平进行了客观、科学、正确地评价，为河口生态健康评价提供了一种新的理论依据和方法。随着河口生态健康评价理论研究的不断深入，在数据代表性及评价标准的统一性等方面仍需要进一步探讨。