本研究首次通过高通量测序技术获得小麦7号同源群D组染色体长臂的高覆盖度普查序列,并用Sanger测序技术获得一些BAC末端序列,从中分析了 SSR位点信息,并大规模的开发了 7号D组染色体特异的SSR分子标记并进行多态性研究。利用细胞流式仪分离小麦品种中国春7DL染色体的染色体DNA,然后利用Illumina Hiseq2000测序平台进行高通量测序,共获得14.54 Gb的序列,用Velvet软件进行拼接后,共获得161,061个片段,其中每个片段长度不少于200bp,共223Mb,数据见http://www.wheatgenome.info.。利用Sanger测序技术对96个BAC克隆测序共成功获得47条BAC末端序列,7DL普查序列和BAC末端序列SSR位点以及SSR分子标记通过SSR Locator软件获得,普查序列161,061个片段中共得到23,272个SSR位点,其中重复单元为2个的SSR重复元件最多（10562）个占总数的45.39%,重复单元为1个的SSR重复元件居第二位（6957）,占总重复单元数目的29.89%,然后分别是3个重复单元（5250,22.56%）、4个重复单元（420,1.8%）、6个重复单元（49,0.21%）,以及5个重复单元（34,0.15%）。所有预测到的SSR位点中11,656个可以设计引物。47个BAC末端序列共获得SSR位点32个,其中重复单元为2个的SSR重复元件1个,重复单元为1个的31个,32个SSR位点中有19个可以设计引物。从7DL普查序列获得的11,656个引物位点中随机选取33个,7DL BAC末端序列获得的19个SSR引物位点中随机选取6个,用Primer premier5.0软件设计引物,在20个小麦品种（Kennedy,Sunco,and Westoniq（澳大利亚）;Barra and Lampo（意大利）;Shango（英国）;Antti,Market,and Soissons（法国）;Boomer,Campari and Korund（德国）;SD05004,SD96240-3-1,T03A0148,and Wheaton（美国）;海盐种,川麦 42,小偃6号和中国春（中国））中进行SSR引物验证以及多态性分析,并用2个中国春缺体材料（N7DT7A和N7DT7B）作对照来验证SSR引物的特异性,最后用POPGENE v 1.3.1软件分析多态性。结果显示7DL普查序列的33个SSR引物中有30个可以扩出条带,26个SSR引物可以扩出目的条带,并且有18个有多态性,且都是7D特异的SSR引物,7DL BAC末端序列的6个SSR引物中有2个可以扩出目的条带,并且是7D特异SSR引物,但均没有多态性。木研究首次通过Illumina Hi Seq2000高通量测序技术来获得单个小麦染色体臂的特异性分子标记,开创了新的特异分子标记开发途径,这些特异性分子标记可以为饱和小麦7DL遗传图谱、构建小麦遗传连锁图谱以及基因定位及图位克隆做贡献。