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中华绒螯蟹（Eriocheir Sinensis）作为一种极为重要的淡水经济甲壳动物,其养殖业在迅猛发展的同时,病害问题也非常突出。同时,抗生素的广泛使用和过度滥用又会导致其残留和耐药性问题加剧,对中华绒螯蟹养殖质量安全亦构成了一定的潜在威胁。光合细菌因其自身能够分泌胞外蛋白酶、硝酸盐还原酶、亚硝酸盐还原酶、一氧化氮还原酶和一氧化二氮还原酶和细菌素等,且富含蛋白质、生物素、辅酶Q10、维生素B12、叶酸及矿物元素等多种生理活性物质,在中华绒螯蟹养殖中具有广泛应用,被证实具有良好的水质净化、抑菌、促生长和抗病等功效。然而,我国目前用于水产养殖的光合细菌多为沼泽红假单胞菌（Rhodopseudomonas palustris）等厌氧菌种,好氧菌种资源较为匮乏,从而导致现有的光合细菌发酵繁殖速度慢,细胞易自溶而导致菌含量在贮藏过程中下降速度快,保质期短。因此,如何筛选获得在中华绒螯蟹养殖中具有良好抗病效果的光合细菌好氧菌株具有重要的研究意义与应用价值。鉴此,本研究以类胡萝卜素产生能力作为筛选评价指标,从养殖池底泥中分离筛选出了1株具有良好的产类胡萝卜素能力的好氧光合细菌SY5,在对其进行了表型鉴定与分子鉴定的基础上分析了其药敏特性、传代稳定性等表征,并根据农业农村部发布的《直接饲喂微生物和发酵制品生产菌株鉴定及其安全性评价指南》,从抗菌药物敏感性、产毒能力、致病性及基于全基因组测序（WGS）的致病因子分析等角度入手对菌株SY5的安全性进行了评价,并研究了其在不同浓度下对中华绒螯蟹血清非特异性免疫力、肝胰腺抗氧化能力、肠道微生物菌群多样性及对抗弗氏柠檬酸杆菌感染保护的效果。研究结果如下:1.菌株SY5为固氮红细菌（Rhodobacter azotoformans）,革兰氏染色阴性,细胞呈卵圆形,在营养琼脂平板上的菌落特征为深红色、圆形、边缘整齐、光滑、湿润;对阿莫西林、新霉素、庆大霉素、四环素、多粘菌素B、恩诺沙星、环丙沙星、卡那霉素、氨苄西林、罗红霉素、磷霉素、链霉素高度敏感,对多西环素中度敏感;连续传代30代,其形态学特性、生理生化特性、繁殖特性和类胡萝卜素产生能力均表现出良好的稳定性。2.菌株SY5对中华绒螯蟹具有良好的生物安全性,对氨苄西林、庆大霉素、卡那霉素、链霉素、四环素和粘菌素的MIC为0.625 mg/L,对磷霉素的MIC为1.25 mg/L,对环丙沙星的MIC为0.039 mg/L;无溶血性,不产生亚硝酸盐、硫化氢、吲哚等有毒有害代谢物,不会分解尿素成有毒的氨氮,亦不会分解苯丙氨酸成有毒的苯丙酮酸;在肌肉注射和拌饲口服两种方式下,对中华绒螯蟹的半数致死浓度分别大于5.0×10~8 CFU/m L和6.0×10~9 CFU/g饲料。此外,菌株SY5的全基因组大小为4,442,977 bp,含有2个染色体,4个质粒,平均GC含量为68.36%,包含55个t RNA,12个r RNA,4430个编码基因,其中参与DNA复制、重组和修复、氨基酸转运和代谢以及能量生产和转化的编码基因数量最多,但未检测到其全基因组包含CARD数据库中的任何耐药基因和VFDB数据库中的任何毒力基因。3.菌株SY5以终浓度为6.0×10~5～6.0×10~9CFU/g饲料拌饲投喂中华绒螯蟹60d,对中华绒螯蟹表现出良好的提升抗氧化免疫能力、改善肠道菌群平衡和增强抗弗氏柠檬酸杆菌感染能力的效果。具体表现在:（1）菌株SY5处理的中华绒螯蟹血清中酸性磷酸酶、碱性磷酸酶、超氧化物歧化酶、溶菌酶和过氧化氢酶的活性分别较对照组提高了7.88%～20.72%（P＜0.05）、27.55%～31.82%（P＜0.05）、6.28%～13.09%（P＜0.05）、30.17%～59.20%（P＜0.05）、8.66%～12.64%（P＜0.05）,肝胰腺中酸性磷酸酶、碱性磷酸酶、超氧化物歧化酶和过氧化氢酶的活性分别较对照组提高了9.09%～24.79%（P＜0.05）、11.91%～17.53%（P＜0.05）、8.63%～17.56%（P＜0.05）、0.45%～2.65%（P＜0.05）,丙二醛含量较对照组降低了15.07%～33.01%（P＜0.05）;（2）菌株SY5处理的中华绒螯蟹肠道微生物菌群多样性指数中Ace指数、Chao指数和Shannon指数均显著高于对照组,Simpson指数显著低于对照组,肠道微生物菌群中厚壁菌门（Firmicutes）的丰度显著高于对照组,而弯曲杆菌门（Campilobacterota）的丰度显著低于对照组,并能提高肠道微生物菌群中红细菌的相对丰度并降低弗氏柠檬酸杆菌的相对丰度;（3）菌株SY5处理的中华绒螯蟹抗弗氏柠檬酸杆菌感染的有效保护率高达65.4%～100.0%。本研究为菌株SY5作为中华绒螯蟹养殖用微生物饲料添加剂的开发奠定安全高效菌种基础。