菘蓝转录组分析及开花相关基因的克隆与功能研究

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong527
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
合适的抽薹开花时间是菘蓝繁育成功的关键因素之一。部分植物的开花调控途径的研究已经深入,而菘蓝相关的研究还未开展。本文以亳州菘蓝为材料,对花期菘蓝不同部位的转录组进行了测序和分析,筛选出菘蓝开花相关基因,并对菘蓝EMF基因和FLC基因进行了克隆和功能分析,还研究了外源赤霉素对菘蓝开花的影响。本文是首次对菘蓝开花相关基因进行研究,研究结果为菘蓝开花调控途径以及十字花科植物开花分子调控机制研究奠定了一定基础。本文研究结果如下:
  1、于菘蓝的花果期对其五个部位(根、茎、叶、花和果)进行了转录组测序,得到了149,907,857条高质量clean reads,组装为124,508条unigene,其中88,064条unigene与公共蛋白数据库比对得到注释信息。对unigene进行GO和COG分类,分别有55,991和23,072条unigene分成52类和25类。KEGG注释了19,927条unigene,涉及到124个KEGG代谢通路,筛选出植物昼夜节律通路中的80个候选基因。此外,还得到了不同部位大量的差异表达基因,且鉴别出91个潜在开花相关基因。
  2、根据菘蓝转录组测序结果与NCBI数据库中的基因序列进行比对,设计特异性引物,首次克隆得到菘蓝EMF基因的CDS序列,命名为IiEMF。cDNA全长1896bp,预测编码的蛋白质长度为631个氨基酸。通过对IiEMF蛋白质序列比对及进化树分析,发现菘蓝与多种植物的EMF序列存在较高的同源性,且与甘蓝(Brassica oleracea)的亲缘关系最为接近。实时定量PCR结果显示,IiEMF在菘蓝的不同器官中均有表达,且其表达具有组织特异性,在叶中的表达量最高,而在果实中的表达量最低。另外,在不同的发育阶段(抽薹现蕾期、初花期、盛花期、花果期),IiEMF的表达量不同,IiEMF基因在叶片中表达量呈先升后降的趋势,初花期表达量最高;IiEMF基因在花蕾中表达量最高,花果期花中表达量最低。构建了开花途径中关键基因EMF的超表达载体pCAMBIA1300-EMF,经农杆菌介导转化拟南芥野生型Col-0,通过潮霉素筛选及PCR鉴定,获得7株EMF超表达的转基因植株。表型观察发现。过量表达IiEMF基因可促使拟南芥在长短日照下均提前开花,这为后续深入研究IiEMF基因的作用机制奠定了基础。
  3、利用PCR技术对菘蓝FLC基因进行克隆,并获得了其cDNA序列全长,其中包括585bp大小的开放阅读框,所编码的多肽链含194个氨基酸残基,属于MADS-box蛋白。通过和十字花科其他植物的多重比较和NJ树的重建,可以看出它们具有较高的同源性,并且在进化距离上较近。通过实时荧光定量PCR技术对IiFLC的基因表达量进行分析,结果显示在不同的器官中其基因表达量有显著差别,分别为根>叶>茎,并随温度降低而递减,从而在低温春化作用下解除对开花的抑制。构建了IiFLC基因的超表达载体pCAMBIA1300-IiFLC,经农杆菌介导转化拟南芥野生型Col-0。通过潮霉素筛选及PCR鉴定,获得7株FLC超表达转基因植株。表型观察发现,过量表达IiFLC基因抑制了长日照条件下拟南芥的开花,并且抑制了拟南芥AtFT和AtAP1基因的表达。这为后续深入研究IiFLC基因的作用机制奠定了基础。
  4、研究不同浓度的赤霉素对菘蓝的开花、生理指标以及开花相关基因表达的影响,为菘蓝花期调控提供理论依据。结果表明:外源赤霉素对菘蓝开花的影响与赤霉素处理浓度有关。喷施100和300mg·L-1处理使菘蓝花期提前,延长了菘蓝开花时间;而500mg·L-1处理推迟了菘蓝的花期。赤霉素处理使菘蓝叶片数减少,株高增加。菘蓝的抽薹率随赤霉素处理浓度升高而增加,赤霉素促进抽薹的最佳浓度为300mg·L-1。赤霉素处理下IiEMF和IiFLC基因的表达具有明显的组织特异性,并且对不同浓度的赤霉素处理的响应也不同。100和300mg·L-1赤霉素处理在现蕾期对叶中IiEMF基因表达有抑制作用,在开花结果期对叶中IiEMF基因表达有促进作用;而500mg·L-1赤霉素处理主要在开花结果期对叶中IiEMF基因表达有促进作用。在现蕾期,不同浓度赤霉素处理均抑制了花蕾中IiFLC基因的表达量;而在盛花期,100和300mg·L-1赤霉素处理抑制了花中IiFLC基因的表达,500mg·L-1赤霉素处理促进了IiFLC基因的表达。本研究为菘蓝开花机制及外源赤霉素调控提供了理论依据。
其他文献
【摘要】现代心理健康教育是职业高中教育的重要组成部分。在职业高中教育中,班主任重视培养学生的心理素质,有助于学生身心健康成长。本文对职业高中班主任班级管理中,合理使用心理健康教育的方面进行谈论研究,并提出一定的心理健康教育应用方法。  【关键词】心理健康教育 职业高中 班级管理  在现代职业高中学校中,学生正处于身心发展的转折时期,学生的教育方式也从普通教育逐渐向职业教育过渡,学生的发展方向从升学
期刊
【摘要】随着教学改革的深入推进,初中数学教学更加关注学生的综合能力发展,其中创新能力尤其受到大家的重视。培养学生的创新能力,就要从激发其创新思维入手。  【关键词】启发教学 发散性思维 教学形式 教学手段  随着我国社会和经济的快速发展,创新能力成为行业发展的重要支撑,是社会衡量人才的必要标准。一个人或一个国家、民族,只有具备创新能力才能在竞争中立于不败之地,因此,初中数学的教学过程必须关注学生的
期刊
藿香[Agastache rugosa(Fisch.et Mey)O.Kitze]为唇形科藿香属植物,全草均能入药,具有芳香健胃、清咳解暑等功效。我国各地均有分布,多为栽培,主产四川、江苏、河南、河北及东北等地。本文通过氮磷钾不同用量及配比和叶面喷施一定浓度微量元素,探究大量元素氮磷钾和微量元素铁锌铜对藿香生理生化指标、光合作用指标、产量和有效成分的影响,以期掌握藿香氮磷钾营养特性,筛选出提高藿香挥发油产量的微量元素,了解施用大量元素和微量元素对其生长、生理、产量、有效成分含量的影响,建立数学模型,以期为
【摘要】元认知指的是对自己认知行为的认知。将元认知策略应用在高中英语教学中,可以收获到事半功倍的效果。本文介绍了元认知策略的基本概念,并结合实例提出了元认知策略在高中英语阅读教学中的应用策略,以期为广大师生提供参考。  【关键词】元认知策 高中英语 阅读教学 应用途径  英语阅读在高中英语教学中是一项极为重要的环节,在考试中也占据了较大比例的分值。针对这种情况,更应加强对元认知策略的应用。元认知策
期刊
【摘要】初中数学合作学习是通过师生之间、学生之间多边互动,积极合作来完成教学任务的一种教学模式。它充分体现了在教学中学生的互助互动、协同合作,通过自身的探究获得数学过程和结果的感受、体会与理解。文章对于新时期合作探究式教学在数学教学中的应用实践进行了探讨,供同仁参考指正。  【关键词】合作探究式教学法 初中数学 教学实践  前言  合作探究式教学法是新时期课程改革下衍生出的一种新型的教育方法,合作
期刊
【摘要】社会的发展与进步, 给学生提出了更高标准的学习任务,学生除了要掌握坚实、丰富的课本知识外,还要拥有“使用”这些知识的能力,如果以素质教育评价的话,素质培养将成为教育教学的终极目标。本文分析了初中数学教师应该转变教学观念,阐述了初中数学思维能力的培养。  【关键词】初中数学 素质教育 数学能力  初中数学教学中的素质教育不仅可以有效培养学生的辩证唯物主义观点,激发学生的爱国主义热情,更是对增
期刊
俗话说,好的开始是成功的一半。任何一件新事物的开始,都会比较困难,但是只要把头开好了,后面的路走起来也就顺畅了。而化学作为初中教学过程中九年级才考生的一门学科,是同学们之前都没有接触过的一门学科,对大家来说感到非常陌生。笔者结合自己多年的初三化学一线教学经验发现,很多学生在接触一门全新的学科的时候,都感到非常恐惧,害怕自己学不好,学不会。而这个时候,老师就应当在这个过程中扮演到重要的较色,起到举足
期刊
【摘要】思想政治教育是德育教育的重要内容,提高思想政治教育对于培养学生的人格和促进学生的全面发展具有重要的意义。然而,在传统的思想政治教育教学中,往往都是填鸭式的教学,教师只是一味的讲授,而学生则成为被动的接受者。本文分析了目前我国高中思想政治教学中学生参与能力比较差的原因,并结合新课程改革的要求提出了一些解决对策,以提高思想政治教育的有效性。  【关键词】高中思想政治教育 学生参与 现状 对策 
期刊
【摘要】文章从农村初中学生听力的成因分析,加强农村初中学生听力教学训练策略两方面来阐述。  【关键词】农村初中英语 听力教学 训练策略  在初中英语教学中,听力是不容忽视的环节,训练听力有助于全面提高学生的英语交际能力。随着英语新教材的启用,加强学生的听力训练,提高学生听力理解水平,已经受到广大英语教师的高度重视  一、农村初中学生听力的成因分析  1、教师教学方法不当  在农村日常教学中很多英语
期刊
【摘要】如果教师忽视了学生学习积极性的激发和调动,思想政治课教学必将失去吸引力,就会失去来自主体的最有力的动力。因此,思想政治课教学应特别重视对学生学习积极性的激发和培养,努力增加吸引力。  【关键词】高中政治 激发 学习兴趣 方法  一、让课堂多一点笑声  思想政治课教学中,政治教师要运用富有感染力的语言去拨动学生的心弦,让他们的心灵受到震撼而产生共鸣。一个具有幽默感的教师往往会受到学生欢迎,会
期刊