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株高是小麦遗传改良的重要目标性状之一。研究表明,自上世纪中叶开始广泛利用的Rht-B1b和Rht-D1b等矮秆基因存在明显的副效应,如粒重降低和对非生物逆境的适应性减弱。因此,发掘和利用新的矮秆基因一直是小麦遗传育种领域关注的热点。本论文在前期研究的基础上,以普通小麦豫麦8679和京411及其衍生的剩余杂合系和近等基因系为材料,精细定位了 2D染色体短臂上的两个控制株高和穗长的QTL,即QPht/Sl.cau-2D.1和QPht/Sl.cau-2D.2,进一步明确了单位点水平上的遗传效应,并采用图位克隆策略鉴定出QPht/Sl.cau-2D.2区间内的候选基因,初步确定了功能变异位点。主要结果如下:1.为了精细定位QPht/Sl.cau-2D.1和QPht/Sl.cau-2D.2,利用小麦和粗山羊草的参考基因组序列数据进行标记加密,构建了覆盖2个QTL位点的遗传连锁图谱,长度为70.11cM,含有75个分子标记,包括17个新开发的SSR标记。在此基础上,以剩余杂合系RIL171衍生的两个次级分离群体Ⅰ和Ⅱ为材料进一步证实了两个QTL。其中位于SNP标记BS0002223451和BobWhiterepc63957147之间的QPht/Sl.cau-2D.1为一个新的QTL位点,可解释株高和穗长变异分别为4.39～11.94%和30.94-40.63%;位于标记SSR-2062和Xgwm484之间的QPht/Sl.cau-2D.2与已命名的Rht8基因定位区间一致,可解释株高和穗长变异分别为4.12～12.96%和31.31-41.95%。在精细定位的基础上,开发了分别与QPht/Sl.cau-2D.1和QPht/Sl.cau-2D.2紧密连锁的分子标记,即STARP-2001和SSR-2433,可用于标记辅助选择育种。利用STARP-2001标记进行分析发现,QPht/Sl.cau-2D.1位点的矮秆等位基因的利用频率较低,可在育种中加强利用。研究还发现,QPht/Sl.cau-2D.2可以减小穗下节的薄壁细胞长度,但是QPht/Sl.cau-2D.1不影响细胞长度,说明其作用机制存在明显的差异。2.为了深入解析QPht/Sl.cau-2D.2（Rht8）的遗传学基础,以剩余杂合系RIL171衍生的次级分离群体为材料（3812个单株）,利用QTL定位区间内的分子标记,筛选出了 35个交换单株。通过比较不同类型交换单株后代的株高和穗长,将矮秆基因定位于标记INDEL-2005和SSR-2433之间,对应普通小麦中国春参考基因组的物理区间为94Kb,其中仅含有一个编码蛋白的未知功能基因（Rht2DS-a）,且编码的蛋白定位于细胞核内。基因组序列分析结果显示,与京411相比,豫麦8679的候选基因序列存在一个碱基的缺失和一个碱基的替换,导致翻译提前终止。据此,开发了一个功能标记,并发现豫麦8679的等位变异类型在二倍体祖先种粗山羊草（DD）中也存在。